Linkedomics数据库使用介绍

Linkedomics

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属性(Attribute)是指待探索的基因、microRNA等;待查数据集(Search Dataset)指待筛选数据集的属性,包括RNA-seq、甲基化、突变和miRNA等;靶数据集(Target Dataset)指作为参照或总体的数据集;肿瘤队列(Cancer cohort)指研究的肿瘤类型。

以基因在数据库中的表达为例:

  • Step 1 - 登陆账号(需要edu邮箱)
  • Step 2 - 选择数据集:如肾上腺皮质腺癌 Adrenocortical carcinoma (ACC)
  • Step 3 - 选择数据类型-HiSeq RNA(高通量RNA-seq)
  • Step 4 - 可选项,数据要求,如肿瘤的分期分级
  • Step 5 - 选择想要研究的基因
  • Step 6 - 选择统计学方法,然后点击“submit query”如pearson correlationl test
  • Step 7 - 生成后不是自动选择呈现的数据,要自动点击圆点后页面下方才会有结果显示。
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