网络不好如何装包，本地安装方法和注意事项

1.R包正规军：大多数的包可以被镜像解决

R包正规军有两支部队，一支是CRAN，是R语言官方网站，各种方向都有。一支是Bioconductor，生信专属。

在装包之前运行这两句代码，安装R包的函数就会自动从镜像网站下载:

options("repos"=c(CRAN="http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))
options(BioC_mirror="http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor/")

镜像网站相当于主网站的副本，访问主网站存在障碍时，访问镜像网站也可。
存放R包的网站位于国外，选择国内的镜像可加快访问速度。

就可以快到飞起！

举两个栗子

cran的

install.packages("tidyr")

bioconductor的

BiocManager::install("limma")

2.正规军里的特殊兵

一种是被淘汰了的

一种是跑的太快的

为什么跑的太快也算特殊呢?

因为这个包只支持4.4，如果你还用着4.3，那就不能方便的用install.packages来安装。

你说那我更新R语言版本不就好了吗？

是呀，那不是懒得更新吗，补补还能用。

不管是太旧还是太新，都可以参考下面链接里的Matrix包，方法是一样的：https://www.yuque.com/xiaojiewanglezenmofenshen/blp0xy/rr54tq5obxhgt06b

3.github游击队

正常的在线安装也还算方便，例如

devtools::install_github("jmzeng1314/idmap1")

括号里写包的作者的用户名加包名，可以在网页山很轻松的查到

但是遇到网络问题就装不了了。因为是非正规军，所以耶没有镜像，如果下载太慢的话那就按照我这里教的来：

https://github.com/xjsun1221/tinyarray

Click the green button "code" on this page, then click "Download ZIP" to download it to your working directory. Install it with devtools::install_local("tinyarray-master.zip",upgrade = F,dependencies = T).

不论是github的本地安装还是cran的特殊包的安装，都不如正规军丝滑，有的依赖包不能自动安装，需要自己看报错信息“缺啥补啥”，安装报错的R包。