39 - 动物模型需要考虑的效应

在构建动物模型时,需要考虑影响牛和性状的效应:

  • 1 时间和位置 - 固定效应
    (1) 时间上:环境改善或变坏(太多月或者太热);饲料质量和数量随时间改变; 分类可以采用星期,月,年(可以根据产犊时间)。但是需要确保每个类别中具有足够的牛数.
    (2) 如果数据收集来自动物地区(分布很广),则应该也考虑位置效应
    一般采用两者进行交叉: 产犊季节x年x位置

-2 临时分组 - 随机效应
一般是考虑: 牛场(herd,代表管理系统) x 产犊年(calving year). 动物在不同群体不同年份饲养。如果想要更细分,可以将产犊年改为产犊季节或产犊月份
当然,对于犊牛进行断奶,和公,母分开饲养,也可能加入其中:herd x calving year x management
当然也有: herd x calving year x calving season 当做固定效应,氮使用herd在calving year x calving season可能没有意义,如果数据为20或30年的数据. 如果为短时间收集的数据,则可行。
但是在将herd x calving year 作为随机效应后,不能再将herd x calving year x season 作为固定效应

  • 3 与时间交互的固定效应
    305天产奶量可能随着母牛的产奶年龄发生变化,随意一般也会对这类性状,考虑calving age,这可能是随着时间改变,饲料发生了改变。
    模型应该被认为是动态的和不断发展的,而不是多年或几代人的静态。

  • 4 加性遗传效应 - 随机效应
    最初假设,动物需要随机交配,但是因为对动物进行育种,这个假设时不成立的。

需要完整的关系矩阵来描述这个关系。
但是因为GS对犊牛的提前选择,会使随机交配产生更大偏差

需要注意对未知父母分组。
对于老数据的使用

  • 5 永久环境效应 - 随机效应
    当一个性状在一个泌乳期或短时间测量多次的话,可以估计其永久环境效应。其在实际中最常用。
    但是环境一般不是不变的, 在动物模型中应使用累积环境影响而不是永久环境影响。
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
平台声明:文章内容(如有图片或视频亦包括在内)由作者上传并发布,文章内容仅代表作者本人观点,简书系信息发布平台,仅提供信息存储服务。

推荐阅读更多精彩内容