什么是 RT-PCR？ RT-PCR 就是逆转录 PCR（reverse transcription PCR）或者称反转录 PCR（reverse transcription-PCR, RT-PCR），是聚合酶链式反应（PCR）的一种广泛应用的变形。在 RT-PCR 中，一条 RNA 链被逆转录成为互补 DNA，再以此为模板通过 PCR 进行 DNA 扩增。
那什么是 qPCR、Real-time-PCR？
其实 Rea-time-PCR 和qPCR（Quantitative Rea-time-PCR）是一码事，都是实时定量 PCR，指的是 PCR 过程中每个循环都有数据的实时记录，因此可以对起始模板数量进行精确的分析。
虽然 Real-time PCR（实时荧光定量 PCR）和 Reverse transcription PCR（反转录 PCR）看起来都可以缩写为 RT-PCR，但是，国际上的约定俗成的是：RT-PCR 特指反转录 PCR，而 Real-time PCR 一般缩写为 qPCR（quantitative real-time PCR）。
那什么是 real-time RT-PCR（或 RT-qPCR）？
real-time RT-PCR 中间的「RT」是 reverse transcription（逆转录），整个意思就是利用 mRNA 或 总 RNA 为模板的实时逆转录 PCR 技术（quantitative Real-time RT-PCR）。real time RT-PCR 指的是 qPCR+RT-PCR 的组合，是说将 mRNA 逆转录为 cDNA 后再作为模板进行实时荧光 PCR 分析，因为 RT-PCR 是可以定性的，但不能进行定量检测的。
所以不难理解 real-time RT-PCR（RT-qPCR）就是结合了荧光定量技术的反转录 PCR：先从 RNA 反转录得cDNA（RT），然后再用 Real-time PCR 进行定量分析（qPCR）。
所以，实时荧光定量 PCR，它不仅可以用 cDNA 作为模板，也可以用基因组 DNA 等
来源：丁香园
