这两个放一起讲不是说它们有什么联系，只是这方面的信息太少了，几乎只能连蒙带猜，所以直接放一起了。
先讲板仓卓的软件。既是上帝也是恶魔，逆转时光洪流让死者复苏，还能危害全人类的软件，我能想到的只有用大数据来复原人的意识，包括死者和虚拟人物。a药名单按我的推理是按照智商来排名的，那么组织里已经有通过大数据来分析智商的软件了，板仓卓研发的应该是进一步整合成意识的东西。组织要这个软件大概是为了复原出历史上和虚拟作品中所有的高智商人物，估计想复原的至少有三水吉右卫门、福尔摩斯、暗夜男爵。组织里有福尔摩斯迷，暗夜男爵登场都或多或少提到组织，而且组织里用来保护资料的软件也被称为暗夜男爵，不过究竟是谁起的名字就不知道了，如果实际上是组织先起的名，那么组织里有优作的粉丝。
而三水吉右卫门这个角色就很微妙，boss邮箱登场时同时是此角色初次提到，而且同时还是难得的在基德登场时出现死者的案件中，秀一在柯南他们提到这个人的机关盒时端锅进博士家，而平时端锅都是在出了什么事或者有什么组织线索的时候，这个机关师大概和组织有什么联系。并且此人登场总和小偷有关（大部分是基德），450话系列很多人因为那个假面超人宿敌登场而怀疑高木长介，但此人看起来正义感很强，不像是组织成员，所以我想此处的宿敌可能是指那个总部在鸟取县的盗窃团伙，或许这个盗窃团伙和那个机关师有什么关系。考虑到73说过鸟取县与组织无关，但灰原曾在意过柯南查鸟取县，所以我觉得可能是组织和那个盗窃团伙作了交易，让那个团伙在偷东西时顺便帮他们找一些和三水相关的东西，那个盗窃团伙可能并不知道和他们交易的是组织。另外柯南被称作“基德杀手”，从梗的角度讲，如果基德暗示那个盗窃团伙，那么这大概是暗示未来端掉这个盗窃团伙的是柯南。至于组织弄出这个盗窃团伙是为了什么，我想可能和三水吉右卫门有关，可能是通过盗窃财产来掩饰寻找和此机关师有关的什么东西，或许和乌丸妈妈留下的宝藏有关。基德还有魔术师的属性，或许那个十年前失踪的魔术师和组织以及三水有关。
提到盗窃团伙，漫画里有个让人在意的事：大和敢助是在追一个犯过盗窃罪的逃犯时遇上了雪崩，他第二次与柯南见面时就表现得好像知道柯南和小五郎的真实实力，这就不由得让人怀疑当时可能不是遇上雪崩那么简单。而且漫画中多次出现疑似公安和冰雪元素一起出现：基德瞬移那次有一个提案“放入巨大冰块中”，而此案解决篇标题是“zero”；伤疤秀一二次登场时是个伪装成雪崩的杀人案，按我的理论此时波本已经改红了；宝石真的放进冰中那一系列，高明出场，且在此系列知道了弟弟的死讯；雪山篇高明和安室透见面，此系列有一个奇怪的地方是黑田要跟高明说话却打的是敢助的手机。所以我想会不会是那个盗窃犯和组织有什么交易，逃跑的时候往组织那里跑了，结果敢助和组织碰面了，差点被杀并遇上雪崩，然后被黑田等追查组织的警察所救，让敢助别把关于组织的事往外说，并故意隐瞒他进医院的事，好避免他被组织发现并追杀，然后和黑田一样，因为受伤，人们在描述他的外貌时主要以伤疤和瘸腿为主，反而导致以受伤前样貌来寻找他的组织暂时没注意到他。有一点在意的是这个半年前究竟是在新一变小前还是变小后，毕竟敢助初登场时差不多波本篇开始了。
而贝姐要这个软件的目的就很简单了，就是重现出父亲的意识，然后找机会把父亲身上所有的意识都清除，再灌进复原出来的父亲的意识，从而拯救父亲。
至于板仓卓为什么会去研发这种软件，我想可能还是和羽案有关，或许当时他想尝试复活羽田浩司（在cg界大放异彩可能也与此有关），后来担心出什么差错或者被坏人利用导致什么危机出现，所以才放弃了研发。顺便说一件有意思的事，板仓卓登场差不多M5、M6上映，把M5里那个看人十年后长相的装置、M6里那个神奇的人工智能与我猜测板仓卓想做的事对比一下，是不是有种微妙的感觉？
而宝藏方面，陨石案中提到找到一颗陨石就可能在周围发现更多，那么现在组织应该在找除了大黑得到的那块以外的同类陨石，陨石案若狭应该也是冲着陨石去的，裤子口袋有可能是在找陨石的时候不小心在哪里勾破了，那桶把手机弄坏的水搞不好是在查看一圈后明白可能要发生什么提前准备的（毕竟这桶水出现得实在是有点……），灰原最后看的方向说不定是若狭为了能得知此陨石是否和那种陨石有一样功能、以及剩余陨石下落而在那里放了窃听器（放窃听器还有一个目的是看安室透会不会因为那颗将棋带公安来）。至于大黑得到的那块，原本大概是放在危命复活的那个钟乳洞里，毕竟费半天劲设置了个暗号居然只代表出口实在是奇怪，而且那里有疑似人工造出的河道，很容易联想到三水的机关，说不定原本有什么东西被拿走了。
羽田家可能也和宝藏产生了什么关系。如果说黑田和羽案产生联系和他的身份有关、阿曼达参与羽案和她的人脉有关，那羽田浩司又为什么要用这么危险的方式去和组织对峙？若狭不销毁棋子还随身携带也很奇怪，虽然说钓红方的鱼可以勉强解释，但是像胁田一样直接询问更安全，因此羽田浩司可能还设了让若狭无法丢掉棋子的局，不知道是不是和那个软件里隐藏的信息有关。羽田家是将棋世家，危命复活的那个洞的暗号和将棋有关，因此他们家有组织要的宝藏的概率不小，如果再从务武那里听说陨石的事情，那么这可能是羽田浩司要出面对峙组织的原因。如果羽田浩司把宝藏藏了起来还用将棋做钥匙，并把相应信息塞进软件里，那么rum的确无法丢掉将棋，还必须随声携带好第一时间开锁。那个将棋能做钥匙大概是靠上面特别定制的字和划痕，只有字还可以单纯复制个平面，但那个划痕是立体的，因此组织就算想复制也得做出和这个将棋一样的棋子（想想组织里有一堆这样的将棋还挺喜感的）。
至于组织要的宝藏还有没有其他的就不知道了。不过博士家大概有组织要的宝藏，博士的车子疑似有宝藏的梗，与芙莎绘见面时车上有三人份餐盒却只见两人也很微妙，不知道是不是组织已经注意到他了。
虽然说乌丸的宝藏具体除了陨石外毫无线索，但作品中多次出现费尽心机寻得的宝物只是前人包含浪漫感情的东西和不算太多的钱财，我想乌丸母亲留下的宝物最终是一种包含了母爱的东西（类似于M3），对于只在乎利益的人来讲是没什么价值的。
