1、甲基化背景知识

参考资料:https://zhuanlan.zhihu.com/p/109261289
表观遗传学
研究基因的核苷酸序列不发生改变的情况下,基因表达的可遗传的变化。目前已知的有DNA甲基化,基因组印记,母体效应,基因沉默,核仁显性,休眠转座子激活和RNA编辑等。

DNA甲基化
生物体在DNA甲基转移酶的催化下,以S-甲硫氨酸为甲基供体,将甲基转移到特定的碱基上的过程。即保护DNA使基因无法被转录。

甲基化常用方法
1、重甲硫酸盐测序,目前最准确最常用的方法,可做全基因组甲基化测序,但是步骤繁琐价值较高。
2、甲基化DNA免疫共沉淀MeDIP-Seq,基于抗体富集原理进行测序,到那时一般都是富集部分关心区域。
3、三代测序技术,对DNA聚合酶的工作状态进行实时监测yingguang的方法。

CpG岛: CpG是5‘-C-磷酸-G-3’ 的简写,CpG岛是具有高频率CpG位点的区域,即GC这样的碱基连续的出现再DNA片段上,因为这些片段多位于基因的启动子区域,就意味着这些区域一旦发生甲基化,就不能启动基因表达。

实验原理
DNA + 重硫酸盐 ===> C--C(甲基化)/ C--U(非甲基化)+ PCR ===> C--C/U--T

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