Ubuntu 16.04安装Pymesh

最近在配置3D-CODED,其中依赖于pymesh安装包,走了不少弯路,记录一下。

首先,网上有两个不同版本的pymesh(Reference):

我先是pip安装了第一个版本,然后出现报错module has no attribute (form_mesh, save_mesh),于是发现3D-CODED需要的是Qingnan Zhou版本的Pymesh。

所以接着就挨个尝试了上面的各种安装方式。

  1. 编译源码安装,倒是成功编译以及安装到了系统环境下,但是卡在了安装到Anaconda环境这一步,遂放弃。
  2. conda安装,报错提示cuda version is incompatible,告辞!下一个!
  3. wheel文件安装,我的conda环境是python3.7,官方只提供了v3.0的python3.7对应wheel,于是我下载的是这个版本(pymesh2-0.3-cp37-cp37m-linux_x86_64.whl),安装以及测试python -c "import pymesh; pymesh.test()"都非常丝滑,可是到运行3D-CODED的时候出现了奇怪的报错:
python inference/correspondences.py --dir_name learning_elementary_structure_trained_models/1patch_deformation
Traceback (most recent call last):
  File "inference/correspondences.py", line 9, in <module>
    import model
  File "./auxiliary/model.py", line 9, in <module>
    from my_utils import sampleSphere
  File "./auxiliary/my_utils.py", line 7, in <module>
    import pymesh
  File "/home/yu/anaconda3/envs/pytorch-3D-CODED/lib/python3.7/site-packages/pymesh/__init__.py", line 18, in <module>
    from .Mesh import Mesh
  File "/home/yu/anaconda3/envs/pytorch-3D-CODED/lib/python3.7/site-packages/pymesh/Mesh.py", line 5, in <module>
    import PyMesh
ImportError: /home/yu/anaconda3/envs/pytorch-3D-CODED/lib/python3.7/site-packages/torch/../../../libstdc++.so.6: version `GLIBCXX_3.4.26' not found (required by /home/yu/anaconda3/envs/pytorch-3D-CODED/lib/python3.7/site-packages/pymesh/lib/PyMesh.cpython-37m-x86_64-linux-gnu.so)

找不到GLIBCXX_3.4.26。terminal运行strings /usr/lib/libstdc++.so.6 | grep GLIBCXX果然是没有这个版本。左寻右找,参考这个链接安装升级了gcc和libstdc++,找得到对应版本了可还是出现同样的报错。

最后使用了第三方contributor提供的pymesh-v2.1的python3.7 wheel,成功解决。然鹅还是没搞懂为啥v3.0不行,希望未来能出现有缘人给个解答,或者有空再多搜索搜索看看能不能找到答案。
wheel发现于这个issue discusstion,安装命令:
pip install http://imagine.enpc.fr/~langloip/data/pymesh2-0.2.1-cp37-cp37m-linux_x86_64.whl

额外阅读: 【Linux】理清gcc、glibc、libstdc++的关系

©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 216,324评论 6 498
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 92,356评论 3 392
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 162,328评论 0 353
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 58,147评论 1 292
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 67,160评论 6 388
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 51,115评论 1 296
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 40,025评论 3 417
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 38,867评论 0 274
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 45,307评论 1 310
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 37,528评论 2 332
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 39,688评论 1 348
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 35,409评论 5 343
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 41,001评论 3 325
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 31,657评论 0 22
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 32,811评论 1 268
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 47,685评论 2 368
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 44,573评论 2 353