学习小组D7笔记-年糕

今天主要是思维导图


D7-测序基础知识.png

推荐网站:

原理部分:

  1. 测序的世界 由生信星球编写,非常详细地介绍了测序的原理,并且在后半部分有linux处理测序数据的教学;强推!!一定要看!!
  2. 【陈巍学基因】视频1:Illumina测序化学原理
  3. 测序技术原理及常用数据格式简介 由美格基因编写,重点看常用数据格式部分
  4. 测序发展史:150年的风雨历程 由生信宝典编写,据说是花花看过写的最好的测序史

实用网站及工具

  1. FASTX-Toolkit http://hannonlab.cshl.edu/fastx_toolkit/
  • 一款用于处理Short-Reads FASTA/FASTQ文件的程序,里面包含了丰富的Fasta/Fastq文件格式转换、统计等命令。
  1. EMBL → Fasta格式转换(在线工具):
    http://www.geneinfinity.org/sms/sms_embltofasta.html

  2. 常见测序文件格式解析的网站:
    https://genome.ucsc.edu/FAQ/FAQformat.html#format1

  • 该网站包含了各种各样的测序文件格式说明,想了解文件格式各行各列的含义直接找它即可
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