数据结构
1. 知识点
（1）R的赋值符号<-
(2) 在Console控制台输入命令，相当于Linux的命令行
（3）R的代码都带括号，而且必须是英文格式下的括号
（4）getwd () 显示工作的路径
（5）向量（Vector）是由元素组成的，元素可以是字符串或者数字
（6）R语言中的数据框(Data frame)就是表格
（7）函数或者命令不会用时，除了百度和谷歌，？read.table
重点：向量（vector）
a. 向量可以是数值，字符，逻辑等。
b. 向量元素的添加及合并
常用函数为c()，append()
c. 向量批量序列的生成
seq(length=, from=, to=).
length:指定生成个数；from:是指开始生成的点；to:截止点。如果不指定，则默认条件 下：seq(N1,N2,BY=)，其中，n1：开始位置；n2：截止位置；by=指定间隔，
rep() rep(P，N) 重复生成P值N次；2.rep(a1:a2,a1:a2) #重复a1到a2，按a1产生a1 次，按a2产生a2 次
d. 向量排序 sort(); 输出排序后的结果；order()；输出排序后的各个向量位置，
学习了一丢丢，感觉信息量很大。
重点之-数据框
数据框（Data Frames）是一种特殊的列表，其中所用元素长度都相等，列表中的每个 元 素都可以看作一列，每个元素的长度可以看作行数。
创建显式数据框的方法是data.frame()
part1：向量
1. 标量和向量的区别
元素指的是数字或者字符串（用chr表示）等
标量：一个元素组成的变量
向量：多个元素组成的变量
x<- c(1,2,3) #常用的向量写法，意为将x定义为由元素1，2，3组成的向量。
x<- 1:10 #从1-10之间所有的整数
x<- seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数（注意是逗号不是分号）
x<- rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次
注：最后一次赋值是最后的结果.
2. 从向量中提取元素
（1）根据元素位置
x[4] #x第4个元素
x[-4]。#排除法，除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4] #第2到4个元素
x[-(2:4)] #除了第2-4个元素
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素
（2）根据值
x[x==10]#等于10的元素
x[x %in% c(1,2,5)]。 #存在于向量c（1，2，5）中的元素
part: 数据框
卡在了第一步。额。汗！！
（1）读取本地数据
read.table(file = "doudou.txt",sep ="\t",header = T)
（2）设置行名和列名
X<-read.csv('doudou.txt') #在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量X是一个数据框
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号
colnames(X)[1]<-"bioplanet" #有的公司返回数据，左上角第一格为空，R会自动补为x,用这个命令来修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1) #最后row.names的意思是修改第一列为行名
（3）数据框的导出
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)
#分隔符改为逗号，字符串不加双引号（默认格式带由双引号）
（4）变量的保存与重新加载
#这次没有处理完的数据下次想接着用怎么办?--学会保存和重新加载。保存的格式是RData。
save.image(file="bioinfoplanet.RData") #保存当前所有变量
save(X,file="test.RData") #保存其中一个变量load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令
（5）提取元素
- X[x,y] #第x行第y列
- X[x,] #第x行
- X[,y] #第y列
- X[y] #也是第y列
- X[a:b] #第a列到第b列
- X[c(a,b)]. #第a列和第b列
- X$列名. #也可以提取列
（6）直接使用数据框中的变量
options(stringsAsFactors = T)
a <-data.frame(case=paste0("S",1:9),values=runif(9))
plot(a$case,a$values)
小技巧
attach
将数据框名添加到搜索环境中：attach（a）,作图时就只需输入列名(连$都不用了)
做完后将a删除出搜索环境 detach（a）
局限性：两个以上数据框的列名有冲突时，同时attach会报错。
with
with(a,{
plot(case,values)
x<<-summary(values)
#求和并赋值给x,<<的意思是作为全局变量，也就是出了大括号仍有效。
})
x #运行完后打印x
脚本文件的后缀就是R，在R语言里还是很在意后缀的。
save(X,file="test.RData")
出现报错：object X not found，
为什么？字面意思：没有找打X，保存变量X时出了问题，解决方法：额。
