相关性热图绘制

引言：在基迪奥公众号看到的一篇推文，应用于物种与代谢物相关性程度的热图的可视化效果，及清晰的相关性热图绘制步骤及脚本，做个记录。

原文链接

效果图

主要步骤

1. 加载R包，psych, pheatmap, reshape2, 分别是计算相关性、p值，绘制相关性热图， 输出数据的整合处理
2. 读入数据， 包括微生物丰度信息表及代谢物信息表。前者表头需带有分类水平、物种名称等，第一列为样本名称信息
3. 计算相关性、p值
4. 数据保存，相关系数表格，第一行代谢物，第一列物种
5. 绘制显著性标记
6. 绘制相关性热图

期待什么时候能学习并使用一下。