因为要使用本地blast
我从conda安装，命令如下：
conda install -c bioconda blast
##安装过程如下：
Collecting package metadata (current_repodata.json): done
Solving environment: done
==> WARNING: A newer version of conda exists. <==
current version: 4.8.4
latest version: 4.11.0
Please update conda by running
$ conda update -n base -c defaults conda
## Package Plan ##
environment location: /home/lzh/anaconda2/envs/Site-seq
added / updated specs:
- blast
The following packages will be downloaded:
package | build
---------------------------|-----------------
ca-certificates-2021.10.8 | ha878542_0 139 KB https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
openssl-1.1.1l | h7f98852_0 2.1 MB https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
------------------------------------------------------------
Total: 2.3 MB
The following packages will be SUPERSEDED by a higher-priority channel:
ca-certificates conda-forge --> anaconda/cloud/conda-forge
openssl conda-forge --> anaconda/cloud/conda-forge
Proceed ([y]/n)? y
Downloading and Extracting Packages
openssl-1.1.1l | 2.1 MB | ################################################################## | 100%
ca-certificates-2021 | 139 KB | ################################################################## | 100%
Preparing transaction: done
Verifying transaction: done
Executing transaction: done
这里可以看到openssl已经安装了。到这里，大家都会默认软件安装已经完成，能正常运行了。但是，在运行建库步骤的时候，提示有问题：
makeblastdb -in VEGFA.fa -dbtype nucl -out VEGFA20220214
makeblastdb: error while loading shared libraries: libssl.so.1.0.0: cannot open shared object file: No such file or directory
##到这里，我就去百度了。这里我还不知道是要装openssl。我看了下啊，有说要装openssl 1.0.0。我没注意到上面已经装过了。我去查了下，openssl已经到更高版本了。再去查，这里openssl已经有了。那么需要做的就时进行链接。添加到库里。
我去 .bashrc添加。这也是看的网页哈。首先cd到根目录，自己的哈。我没有root权限。然后修改添加。然后source即可。
cd
vi .bashrc
#add
export LD_LIBRARY_PATH=/home/lzh/anaconda2/lib:$LD_LIBRARY_PATH
source .bashrc
到这里再运行 makeblastdb还是报错误。根本原因在与路径下libssl.so的版本的是1.1不是这里的1.0.0。
那么咋弄。复制粘贴
cp libssl.so.1.1 libssl.so.1.0.0
然后运行，就不是再是这个错误了。是下一个错误：
makeblastdb -in VEGFA.fa -dbtype nucl -out VEGFA20220214
makeblastdb: error while loading shared libraries: libcrypto.so.1.0.0: cannot open shared object file: No such file or directory
如是，我去库里看还是版本的问题。复制粘贴下
cp libcrypto.so.1.1 libcrypto.so.1.0.0
再次运行，问题解决。
makeblastdb -in VEGFA.fa -dbtype nucl -out BlastDB/VEGFA20220214
Building a new DB, current time: 02/14/2022 13:52:17
New DB name: /data/ZhL/seq/results0121/BlastDB/VEGFA20220214
New DB title: VEGFA.fa
Sequence type: Nucleotide
Keep MBits: T
Maximum file size: 1000000000B
Adding sequences from FASTA; added 11613 sequences in 0.195394 seconds.
##这里需要看依赖用到了ldd.
