《倚天屠龙记》作为《射雕》三部曲里的最后一部，它在将近百年的时间跨度中，留下了不少漏洞，因此被许多读者认为是三部里质量最差的一部。
这些漏洞诸如阳顶天临终书信、杨逍身份来历、黄衫女三次出现化解危机等，都有点经不起推敲。都不太影响故事发展，毕竟与主角张无忌的主线影响不大。
不过有两处与主角相关的情节，却留下了不小的漏洞，以至于让读者诟病。
张无忌在蝴蝶谷找胡青牛看病。胡青牛号称“见死不救”，所以对不是明教弟子的张无忌并不施以援手。可是张无忌的病情实在奇怪，他忍不住技痒，于是留下张无忌在蝴蝶谷当学徒工。
数年后，胡青牛和王难姑被金花婆婆杀死，张无忌成为“医仙”、“毒仙”的唯一传人，也成为当世唯一的名医。
张无忌精通医术的能力，被金庸先生在多个地方用到。
送杨不悔找杨逍，在昆仑山帮何太冲小妾解了毒，也躲过班淑娴的毒酒。
化解光明顶围攻六大派时，借金蚕蛊逼华山派掌门鲜于通说出真相。又在治疗唐文亮时罗列武林各派的独门秘药。
最关键的一次，是用黑玉断续膏治好了俞岱岩二十年的瘫痪，帮自己父母赎了罪。还让手足寸断的殷梨亭恢复了一身武功，否则就没有后来与杨不悔的婚事。
同九阳神功和乾坤大挪移神功一样，张无忌的医术和毒术，在全书中起到了不可或缺的作用。
可是作为“名医”的张无忌，却有两次栽了跟头，让故事发展有了很勉强的转折。
光明顶上，张无忌为化解明教和六大派仇怨，要化身圆真的成昆出来对峙，却发现圆真已经在跟殷野王拼内力时死去。
按说张无忌精通医理，怎么会看不出这位大仇人是在装死？武林中当然有龟息功之类的功夫可以让人停止心跳和呼吸，但作为医术精通的张无忌不应该在圆真身上犯这样的错误。
如果这次算是张无忌没有亲身试探犯的错，尚可理解。
那么后来对殷离的活埋却真的有点说不过去了。殷离被金花婆婆暗器击中，在四女同舟时一直都是昏迷不醒的状态。后来周芷若偷了倚天剑屠龙刀，把殷离毁了容，又嫁祸给赵敏。
这些事情谢逊固然一清二楚，但张无忌确实不知情。
殷离“死”前，是张无忌一直抱着她，眼看着她在自己怀中停止了呼吸。殷离死后的尸体也是张无忌亲自埋下的，还写下了“爱妻蛛儿殷离之墓”的墓碑。
不过后来周芷若九阴白骨爪被黄衫女识破后下山，转眼间又被殷离追得乱跑——殷离居然起死回生了。
这一下又狠狠地打了张无忌这位“名医”的脸，自己深爱的人死没死都搞不清楚，还把人活埋了？
金庸先生笔下，从来没有出现过起死回生、借尸还魂这类超自然力量，毕竟这是武侠小说而不是玄幻小说，这次安排殷离死而复生，实在出人意料之外。
其实这也不怪张无忌，这样安排情节，金庸先生应该也很无奈。
四女同舟何所望之后，小昭去了波斯，只留下无限的思念。赵敏和周芷若都是女主，以后的情节还全靠两人支撑。殷离存在的话，张无忌的情感故事线又会变得乱七八糟，只好牺牲掉殷离，后面四分之一的情节都是在没有殷离的情况下发生的。
但殷离毕竟死了，还被毁了容，下手的不是赵敏就是周芷若。
如果她不复生的话，周芷若就要被彻底黑化，张无忌心肠再软也不可能跟她走在一起，所以不得已又让殷离回生。
当年的《倚天屠龙记》是在报纸上连载的，发布出去就没有修改的可能。连载成这样的结局，实在不好补救。即便后来金庸先生多次修订，针对这卡在全书四分之三处的关键情节，再修改也不好自圆其说，而且还牵扯到后面十回的内容。真要都改动了，那也许就成了另一本书了。
所以，只好让张无忌来背这口锅，让她亲手把殷离活埋掉。
“那日我不知怎样醒了过来，上下四周冷冰冰的，都是石块。你既要活埋我，干么又在我身上堆了些树枝石头？为甚么不在我身上堆满泥土，我透不过气来，不就真的死了？”
