该数据库致力于收集、整理和提供规范化的miRNA命名信息,为学术界提供方便快捷的查询工具。通过使用这个数据库,研究者能够迅速找到所需的miRNA在不同数据库中的命名信息,避免因命名不规范导致的数据混乱和重复工作,简单、高效、标准地处理miRNA信息。
1. 介绍
功能
miRBase
、HGNC
、previous miRNA
3种miRNA之间ID转换
应用场景
当你想查询你所感兴趣miRNA时,你只知道它的一个名字,检索起来肯定不全面,所以你就可以查查它的族谱,看看它的曾用名
网址
https://haoran-chen.shinyapps.io/miRNA_norm/
2. 使用方法
1. 输入感兴趣的miRNA ID(任意类型),然后点击Search
2. 稍等一会即可获得查询结果
结果包含了以下几部分信息:
- 用户输入数据
- 3个数据库中的ID号
- ID状态
- 未成熟miRNA序列
- 成熟miRNA的ID和序列
如果这个ID没有,可能有那么几种情况:
- 非人类
- 数据库不全,待补全
- 数据库中没有对应关系