乡愁是一座沉入湖底的村落，遍寻却不见故乡的踪影，从此那里就成了再也回不去的地方。《水域》就是一个有关乡愁的故事。
深山村，一个诞生于山林溪涧中的村落，其原住民们在此过着闲适的生活。相传龙神栖息在村里的瀑布，庇佑着这片土地。龙巳与清子是安居于此的一对夫妇，育有一子澄夫。一家三口本过着平静如水的生活，然而澄夫的意外溺亡，让生活起了波澜，成为了夫妻二人心中难以逾越的心坎。
时间来到了数年后，清子诞下一女和澄，三口之家有条不紊地运行着。本以为这样与世无争的闲散日子可以一直持续，直到某天，水库选址在这座村落。一时间，几家欢喜几家愁。有人欣然接受政府开出的补偿，乐于搬往下游的城镇生活。但有的人，比如龙巳，是安土重迁的那一类人。是啊，生于此长于此，深山村早已不仅是家之所在，更是精神之乡，哪有那么容易割舍。就像《海上钢琴师》里出生于船舱的男主1900，至死都没有离开过弗吉尼亚号，因为这艘船给予了他身份与居所；就像《苹果酒屋法则》里自幼在孤儿院长大的荷马，造访过大千世界后又回到了孤儿院，因为落叶总要归根。人人都有自己的根，区别在于有人在人生尽头才归根，有人兜兜转转后归根，而有人从一开始就不愿舍弃根，龙巳就是这最后一类人。所以尽管深山村注定要没入水底，朋友甚至妻女都选择离开，他也固执地不愿离去，只为守候澄夫的灵魂，以及自己熟悉的一切。外面的世界有千千万万条路，千千万万个人，实在太过繁杂，只有这座村落中简单的社会才是心之所向。
龙巳选择驻守，清子与和澄则搬至城镇。数年后，拆迁范围终是到了龙巳家这一带，龙巳终是离开了村子。和澄想彻底掩埋有关深山村的一切回忆，怎料自己的女儿千波却时不时于睡梦中，被拉进澄夫的灵魂所制造的幻境— 几十年前的深山村。澄夫即代表深山村的意志，他的魂魄迟迟不肯散尽，就像深山村不愿被淹没在水库之下。可是魂魄终会散尽，最后深山村也成为了只能被缅怀的存在。
乡愁似乎是个逃不出的怪圈，一代又一代的人在失去着他们的故乡。然后他们接纳了这份乡愁，继续奔波劳碌在纷扰的世间。最后，故乡变成了时不时与于脑海中浮现的残影，他们努力去拼凑它，却发现怎么也无法使其完整。
