第4周:猴痘病识别

一、环境配置

python3.6.13,TensorFlow2.4.0-gpu,cuda 11.0,cudnn8.0.5

二、前期准备

1.设置GPU

from tensorflow import keras
from tensorflow.keras import layers, models
import os, PIL, pathlib
import matplotlib.pyplot as plt
import tensorflow as tf

gpus = tf.config.list_physical_devices("GPU")

if gpus:
    gpu0 = gpus[0]  # 如果有多个GPU,仅使用第0个GPU
    tf.config.experimental.set_memory_growth(gpu0, True)  # 设置GPU显存用量按需使用
    tf.config.set_visible_devices([gpu0], "GPU")

2.导入数据

data_dir = "./45-data/" # 相对路径
data_dir = pathlib.Path(data_dir)

3.查看数据

image_count = len(list(data_dir.glob('*/*.jpg')))

print("图片总数为:",image_count)
"""
图片总数为: 2142
"""
#导入Monkeypox下面的数据并打开第1张图片
Monkeypox = list(data_dir.glob('Monkeypox/*.jpg'))
PIL.Image.open(str(Monkeypox[0]))

三、数据预处理

1.加载数据

使用image_dataset_from_directory方法将磁盘中的数据加载到tf.data.Dataset中

测试集与验证集的关系:

  1. 验证集并没有参与训练过程梯度下降过程的,狭义上来讲是没有参与模型的参数训练更新的。
  2. 但是广义上来讲,验证集存在的意义确实参与了一个“人工调参”的过程,我们根据每一个epoch训练之后模型在valid data上的表现来决定是否需要训练进行early stop,或者根据这个过程模型的性能变化来调整模型的超参数,如学习率,batch_size等等。
  3. 因此,我们也可以认为,验证集也参与了训练,但是并没有使得模型去overfit验证集
# 定义batch_size img_height 和 img_width
batch_size = 32
img_height = 224
img_width = 224
# 将磁盘中的数据加载到tf.data.Dataset
# 训练集
train_ds = tf.keras.preprocessing.image_dataset_from_directory(
    data_dir, # 数据所在目录
    validation_split=0.2, #  0和1之间的可选浮点数,可保留一部分数据用于验证
    subset="training", # training或validation之一。仅在设置validation_split时使用
    seed=123, # 用于shuffle和转换的可选随机种子
    image_size=(img_height, img_width), # 从磁盘读取数据后将其重新调整大小 这里调整到224*224
    batch_size=batch_size) # 数据批次的大小 这里设置的32
"""
Found 2142 files belonging to 2 classes.
Using 1714 files for training.
"""
# 验证集
val_ds = tf.keras.preprocessing.image_dataset_from_directory(
    data_dir,
    validation_split=0.2,
    subset="validation",
    seed=123,
    image_size=(img_height, img_width),
    batch_size=batch_size)
"""
Found 2142 files belonging to 2 classes.
Using 428 files for validation.
"""

# 通过class_names输出数据集的标签。标签将按字母顺序对应于目录名称。
class_names = train_ds.class_names
print(class_names)
"""
['Monkeypox', 'Others']
"""

2.可视化数据

#可视化数据  查看前20张图片 2行 10 列
plt.figure(figsize=(20, 10))
for images, labels in train_ds.take(1):
    for i in range(20):
        ax = plt.subplot(2, 10, i + 1)
        plt.imshow(images[i].numpy().astype("uint8"))
        plt.title(class_names[labels[i]])
        plt.axis("off")
plt.show()
myplot.png

3.再次检查数据

for image_batch, labels_batch in train_ds:
    print(image_batch.shape)
    print(labels_batch.shape)
    break
"""
(32, 224, 224, 3)
(32,)
"""
  • Image_batch是形状的张量(32,180,180,3)。这是一批形状180x180x3的32张图片(最后一维指的是彩色通道RGB)。
  • Label_batch是形状(32,)的张量,这些标签对应32张图片

4.配置数据集

AUTOTUNE = tf.data.AUTOTUNE # 当buffer_size设定为tf.data.AUTOTUNE时,将会自动调整缓冲区的大小
train_ds = train_ds.cache().shuffle(1000).prefetch(buffer_size=AUTOTUNE)
val_ds = val_ds.cache().prefetch(buffer_size=AUTOTUNE)
  • shuffle() :打乱数据
  • prefetch() :预取数据,加速运行
  • cache() :将数据集缓存到内存当中,加速运行

四、构建CNN网络

卷积神经网络(CNN)的输入是张量 (Tensor) 形式的 (image_height, image_width, color_channels),包含了图像高度、宽度及颜色信息。不需要输入batch size。color_channels 为 (R,G,B) 分别对应 RGB 的三个颜色通道(color channel)。在此示例中,我们的 CNN 输入的形状是 (224, 224, 4)即彩色图像。我们需要在声明第一层时将形状赋值给参数input_shape。

num_classes = 2
model = models.Sequential([
    layers.experimental.preprocessing.Rescaling(1. / 255, input_shape=(img_height, img_width, 3)),

    layers.Conv2D(16, (3, 3), activation='relu', input_shape=(img_height, img_width, 3)),  # 卷积层1,卷积核3*3
    layers.AveragePooling2D((2, 2)),  # 池化层1,2*2采样
    layers.Conv2D(32, (3, 3), activation='relu'),  # 卷积层2,卷积核3*3
    layers.AveragePooling2D((2, 2)),  # 池化层2,2*2采样
    layers.Dropout(0.4), # 作用是防止过拟合,提高模型的泛化能力。
    layers.Conv2D(64, (3, 3), activation='relu'),  # 卷积层3,卷积核3*3
    layers.Dropout(0.4), # 作用是防止过拟合,提高模型的泛化能力。

    layers.Flatten(),  # Flatten层,连接卷积层与全连接层
    layers.Dense(128, activation='relu'),  # 全连接层,特征进一步提取
    layers.Dense(num_classes)  # 输出层,输出预期结果
])

model.summary()  # 打印网络结构
Model: "sequential"
_________________________________________________________________
Layer (type)                 Output Shape              Param #   
=================================================================
rescaling (Rescaling)        (None, 224, 224, 3)       0         
_________________________________________________________________
conv2d (Conv2D)              (None, 222, 222, 16)      448       
_________________________________________________________________
average_pooling2d (AveragePo (None, 111, 111, 16)      0         
_________________________________________________________________
conv2d_1 (Conv2D)            (None, 109, 109, 32)      4640      
_________________________________________________________________
average_pooling2d_1 (Average (None, 54, 54, 32)        0         
_________________________________________________________________
dropout (Dropout)            (None, 54, 54, 32)        0         
_________________________________________________________________
conv2d_2 (Conv2D)            (None, 52, 52, 64)        18496     
_________________________________________________________________
dropout_1 (Dropout)          (None, 52, 52, 64)        0         
_________________________________________________________________
flatten (Flatten)            (None, 173056)            0         
_________________________________________________________________
dense (Dense)                (None, 128)               22151296  
_________________________________________________________________
dense_1 (Dense)              (None, 2)                 258       
=================================================================
Total params: 22,175,138
Trainable params: 22,175,138
Non-trainable params: 0
_________________________________________________________________

五、编译

在准备对模型进行训练之前,还需要再对其进行一些设置。以下内容是在模型的编译步骤中添加的:

  • 损失函数(loss):用于衡量模型在训练期间的准确率。
  • 优化器(optimizer):决定模型如何根据其看到的数据和自身的损失函数进行更新。
  • 指标(metrics):用于监控训练和测试步骤。以下示例使用了准确率,即被正确分类的图像的比率。
# 设置优化器
opt = tf.keras.optimizers.Adam(learning_rate=1e-4)

model.compile(optimizer=opt,
              loss=tf.keras.losses.SparseCategoricalCrossentropy(from_logits=True),
              metrics=['accuracy'])

六、训练模型

本次调用了TensorFlow中的ModelCheckpoint函数进行训练模型的保存

#训练
from tensorflow.keras.callbacks import ModelCheckpoint

epochs = 50

checkpointer = ModelCheckpoint('best_model.h5', # 字符串,保存模型的路径
                                monitor='val_accuracy', # 需要监视的值
                                verbose=1, # 信息展示模式
                                save_best_only=True, # 保存最优模型
                                save_weights_only=True) # 为True则只保存模型权重,否则将保存整个模型(包括模型结构,配置信息等)

history = model.fit(train_ds,
                    validation_data=val_ds,
                    epochs=epochs,
                    callbacks=[checkpointer])
训练了50个epoch,val_accuracy达到0.87850

Epoch 1/50
54/54 [==============================] - 8s 39ms/step - loss: 0.7301 - accuracy: 0.5070 - val_loss: 0.6688 - val_accuracy: 0.5818

Epoch 00001: val_accuracy improved from -inf to 0.58178, saving model to best_model.h5
Epoch 2/50
54/54 [==============================] - 1s 21ms/step - loss: 0.6568 - accuracy: 0.6235 - val_loss: 0.6480 - val_accuracy: 0.6238

Epoch 00002: val_accuracy improved from 0.58178 to 0.62383, saving model to best_model.h5

......

Epoch 47/50
54/54 [==============================] - 1s 23ms/step - loss: 0.0657 - accuracy: 0.9797 - val_loss: 0.4926 - val_accuracy: 0.8715

Epoch 00047: val_accuracy did not improve from 0.87850
Epoch 48/50
54/54 [==============================] - 1s 23ms/step - loss: 0.0610 - accuracy: 0.9799 - val_loss: 0.5256 - val_accuracy: 0.8715

Epoch 00048: val_accuracy did not improve from 0.87850
Epoch 49/50
54/54 [==============================] - 1s 23ms/step - loss: 0.0518 - accuracy: 0.9849 - val_loss: 0.5418 - val_accuracy: 0.8621

Epoch 00049: val_accuracy did not improve from 0.87850
Epoch 50/50
54/54 [==============================] - 1s 23ms/step - loss: 0.0739 - accuracy: 0.9759 - val_loss: 0.4881 - val_accuracy: 0.8785

Epoch 00050: val_accuracy did not improve from 0.87850

七、模型评估

1.Loss与Accuracy图

#Loss与Accuracy图
acc = history.history['accuracy']
val_acc = history.history['val_accuracy']

loss = history.history['loss']
val_loss = history.history['val_loss']

epochs_range = range(epochs)

plt.figure(figsize=(12, 4))
plt.subplot(1, 2, 1)
plt.plot(epochs_range, acc, label='Training Accuracy')
plt.plot(epochs_range, val_acc, label='Validation Accuracy')
plt.legend(loc='lower right')
plt.title('Training and Validation Accuracy')

plt.subplot(1, 2, 2)
plt.plot(epochs_range, loss, label='Training Loss')
plt.plot(epochs_range, val_loss, label='Validation Loss')
plt.legend(loc='upper right')
plt.title('Training and Validation Loss')
plt.show()
Loss&Accuracy.png

2.指定图片进行预测

#指定图片预测

# 加载效果最好的模型权重
model.load_weights('best_model.h5')

from PIL import Image
import numpy as np

img = Image.open("./45-data/Monkeypox/M01_01_00.jpg")  #这里是需要预测的图片路径
image = tf.image.resize(img, [img_height, img_width]) #将图片缩放至训练时的大小

img_array = tf.expand_dims(image, 0)
print(img_array)
predictions = model.predict(img_array) # 这里选用已经训练好的模型
print(predictions)
print("预测结果为:",class_names[np.argmax(predictions)]) # np.argmax()是numpy中获取array的某一个维度中数值最大的那个元素的索引
"""
预测结果为: Monkeypox
"""

八、总结

本周新学习到ModelCheckpoint的函数使用,以及对保存出来的模型进行调用预测图片。

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