本系列课程要求大家有一定的R语言基础，对于完全零基础的同学，建议去听一下师兄的《生信必备技巧之——R语言基础教程》。本课程将从最基本的绘图开始讲解，深入浅出的带大家理解和运用强大而灵活的ggplot2包。内容包括如何利用ggplot2绘制散点图、线图、柱状图、添加注解、修改坐标轴和图例等。
本次课程所用的配套书籍是：《R Graphic Cookbooks》
除了以上的基本图形外，师兄还会给大家讲解箱线图、提琴图、热图、火山图、气泡图、桑基图、PCA图等各种常用的生信图形的绘制，还不赶紧加入收藏夹，跟着师兄慢慢学起来吧！
第一章：快速探索数据
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散点图：
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最简单的函数：plot(x, y)
plot(mtcars$wt,mtcars$mpg)
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01.png
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使用qplot
library(ggplot2) qplot(mtcars$wt,mtcars$mpg) qplot(wt,mpg,data = mtcars) # 如果变量x和y都来自于同一个数据框，还可以这样写； -
使用ggplot2
ggplot(mtcars, aes(x=wt, y=mpg)) + geom_point()
02.png
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折线、曲线图：
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同样可以用plot来画：
# plot中type参数可以指定绘图的类型：如："l"就是指折、曲线图 plot(pressure$temperature,pressure$pressure,type = "l") points(pressure$temperature,pressure$pressure) lines(pressure$temperature,pressure$pressure/2, col = "red") points(pressure$temperature,pressure$pressure/2, col = "red")
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03.png
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使用qplot
library(ggplot2) qplot(pressure$temperature,pressure$pressure,geom = "line") qplot(temperature,pressure,data = pressure, geom = "line") # 如果变量x和y都来自于同一个数据框，还可以这样写； -
使用ggplot2
ggplot(pressure, aes(x=temperature, y=pressure)) + geom_line() + geom_point()
04.png
