1.多个转录本：
一个基因产生多个转录本通常是由一种原因或者几种原因导致，最可能的原因有四种：
1. Alternative splicing
选择性剪接（Alternative splicing）是基因的一种表现方式。生物的基因序列中，包含了内含子（intron）与外显子（exon），两者交互穿插，组成基因。其中内含子并不表现，外显子才是能够转录成mRNA（之后再进一步转译成蛋白质）的片段。
而选择性剪接便是利用这样的特性，将同一基因中的外显子以不同的组合方式表现，制造出不同的蛋白质。比如基因Gene ID: 2668的NM_001190468.1转录本和NM_199231.2转录本;
2. Alternative promoter usage
同一个基因可能由不同的启动子导致产生不同的蛋白质，比如Gene ID: 2668的NM_000514.4转录本；
3. Alternative initiation
同一条mRNA中使用不同的翻译起始密码子，通常情况下产生出仅仅在N端有差别的蛋白质序列，比如基因Gene ID: 2668的NM_001278098.1转录本;
4. Ribosomal frameshifting
一种翻译重编码机制，其导致核糖体改变其对遗传密码的读取，产生不是由mRNA直接编码的蛋白质，或者两种甚至更多种不同的蛋白质。
2.外显子、内含子、mRNA、CDS、ORF区
基因DNA分为编码区和非编码区，编码区也就是转录区包含外显子和内含子，一般非编码区有基因表达的调控功能。外显子和内含子都被转录到mRNA前体hnRNA中，当hnRNA经过剪接后变为成熟mRNA后。内含子被剪除(又叫非编码RNA)，外显子保留，真正编码蛋白质的是外显子，但不是所有的外显子都能翻译成蛋白。因为剪接后内含子组成mRNA后，mRNA包括UTR(非翻译区)和CDS(蛋白编码区)。CDS蛋白质编码区，是真正编码一段蛋白产物的序列。
开放读码区ORF 是从一个起始密码子开始到一个终止密码子结束的一段序列，不是所有的读码区都能表达出蛋白产物。 CDS和ORF的关系 CDS必然是ORF，但是ORF不一定是CDS，因为不是所有的ORF都能最终表达产生蛋白产物。 ORF--translation CDS----transcription
