注意事项（引自生信星球）

（1）R的赋值符号不是等号，而是<-
（2）在Console 控制台输入命令，相当于Linux的命令行
（3）R的代码都是带括号的，括号必须是英文的。
（4）显示工作路径 getwd()
　　设置工作路径 setwd("C:/Users/kingjie/Desktop/Rdata")
（5）向量是由元素组成的，元素可以是数字或者字符串。
（6）表格在R语言中改名叫数据框^_
（7）别只复制代码，要理解其中的命令、函数的意思。函数或者命令不会用时，除了百度/谷歌搜索以外，用这个命令查看帮助：?read.table，调出对应的帮助文档，翻到example部分研究一下。

基本知识之向量

1 多个元素（数字或字符串）组成的变量
2 可以对其进行赋值（数值，字符串/数据框）,多次赋值会被覆盖

x<-c(1,2,3) #常用的向量定义写法，意为将x定义为由元素1，2，3组成的向量。 x<-(1:10) #从1-10之间所有的整数 x<-seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数（注意这里是逗号不是分号） x<-rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次

从向量中提取元素（位置，大小）

基本知识之数据框

1 读取本地数据
read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T)
读取文件，分隔符为Tab，有表头
read.csv
2 设置行名和列名

X<-read.csv('doudou.txt')#在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量X是一个数据框
colnames(X) #查看列名
rownames(X)#查看行名,默认值的行名就是行号，1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回数据，左上角第一格为空，R会自动补为x,用这个命令来修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名

3 数据框的导出

write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号，字符串不加双引号（默认格式带由双引号）

4 变量的保存与重新加载

save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(frame1,file="frame1.RData")#保存其中一个变量
load("frame1.RData")#再次使用RData时的加载命令
保存的格式是RData。

5 提取元素

- X[x,y]#第x行第y列
- X[x,]#第x行
- X[,y]#第y列（横着写，这是不够懒也不够优秀却能存在的写法）
- X[y]#第y列（竖着写，这是懒惰又优秀的写法）
- X[a:b]#第a列到第b列
- X[c(a,b)]#第a列和第b列

- X$列名#也可以提取列（优秀写法，而且这个命令还优秀到不用写括号的地步，并且支持Tab自动补全哦，不过只能提取一列）

优秀方法

1attach(c)
plot(case,values)
2with(c,{+ plot(case,values)x<<-summary(values)}) #求和并赋值给x,<<的意思是作为全局变量，y也就是出了with循环仍有效。
x #运行完后打印x