IGV展示gff文件

1. 加载基因组文件

Genomes➡️Load Genome from File➡️点击自己的基因组


2.加载gtf/gff文件

2.1. Tools➡️Run igvtools
2.2. File➡️Load from File➡️ *.sorted.gff

3. 大功告成


备注:有些文章说,sort之后还要做index。我做index再导入的话会报错,用上面这种方法就可以解决。好玩的是,有时候导入sorted文件,它会说你没做index,那你点击GO就可以了;不报警报的话就直接导了。


附录:发现了一篇讲igv很详细的文章https://www.jianshu.com/p/9221ce6c5092

最后编辑于
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
平台声明:文章内容(如有图片或视频亦包括在内)由作者上传并发布,文章内容仅代表作者本人观点,简书系信息发布平台,仅提供信息存储服务。