awk小技巧

  1. 按列拆分
awk '{print > $3}' all.gff3
gff3文件
将gff3按第三列拆分
  1. 行-列转化
    需要将如下格式转换成“一个基因号对应一个 GO 号”

转化命令:awk '{gsub(/,/, "\n"$1"\t");print}' pta_go.txt > pta_go.annot

参考:http://mp.weixin.qq.com/s/JuuQ3wFJq72A36t5-arHIg

最后编辑于
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
【社区内容提示】社区部分内容疑似由AI辅助生成,浏览时请结合常识与多方信息审慎甄别。
平台声明:文章内容(如有图片或视频亦包括在内)由作者上传并发布,文章内容仅代表作者本人观点,简书系信息发布平台,仅提供信息存储服务。

相关阅读更多精彩内容

  • 转载 原文的排版和内容都更加友好,并且详细,我只是在这里贴出了一部分留作自己以后参考和学习,如希望更详细了解AWK...
    XKirk阅读 8,506评论 2 25
  • 1、Nginx日志分析日志格式:'$remote_addr - $remote_user [$time_local...
    运维前线阅读 4,170评论 0 4
  • awk: grep,sed,awk grep:文本过滤 sed:文本编辑 awk:文本格式化工具; 1 什么是aw...
    木林森阅读 5,805评论 0 16
  • 本章主要学习内容awk介绍 awk基本用法 awk变量 awk格式化 awk操作符 awk条件判断 a...
    楠人帮阅读 5,087评论 0 8
  • awk:报告生成器,格式化文本输出 内容: awk介绍 awk基本用法 awk变量 awk格式化 awk操作符 a...
    BossHuang阅读 5,328评论 0 9

友情链接更多精彩内容