安利Freeplane+Zotero用于思路/文献整理

Freeplane思维导图

最近整理课题资料，经过一番学习全面开启用Freeplane做思维导图的新世界，我现在整理思路、管理日常小任务都在freeplane中完成，感觉整个人活清醒了不少……同时我用Zotero进行文献管理，这两个软件一结合产生了一个很强大的功能：Zotero中的文献拖拽到思维导图中，可以方便地从思维导图中点超链接打开文献。先看看我怎么用Freeplane思维导图吧：

这个是我任务管理的思维导图，作为daily日记本使用。我设置了几个方块（node）的格式选项，根据我贴的紧急程度标签，node自动选择格式。我会把需要做的事按图上红、黄、绿的优先顺序进行。当然，这个标签可以根据任何分类标准来设置，比如我研究思路的图里，就是按node的内容来设置标签和格式。

这个是我研究课题的思维导图，不仅把各个话题联系起来，而且相应的内容是哪篇文章里的，都被我放在超链接里了，一点就能直接打开文章的pdf。链接文章也很简单，直接从Zotero里面拖过来就可以。有的时候我在文献的pdf做的笔记勾画我也放在思维导图的note中，从Zotero复制粘贴过来就可以了。这个便利要感谢Zotero从pdf中抓笔记和勾画的功能。这个图我也采用了红黄绿的标识（另外还有一些其他的标识系统），每次想东西的时候直接从红色的标识下手，避免了一开始进入状态前的迷茫阶段。

根据我的摸索，Freeplane基本上可以满足各种需要，刚开始可能要摸索一番，有的功能比较隐藏。Youtube上还有各种意想不到的花式进阶使用方法，直接把freeplane当日常全功能软件来用。我强烈推荐的是Attribute功能，也就是我给我的图加标签的方法。最最重要的是，freeplane一定要结合Zotero使用，当我在思维导图上组织思维的时候，直接能够点开相关的文献是多么重要！

Zotero文献管理

这个是zotero的界面，跟别的文献管理软件大同小异，基本功能是把文献分类整理好，另外能够从pdf自动抓取文献的信息，引用的时候自动生成格式。Zotero是一个免费的开源软件，有很多各路程序员自己开发的插件，所以当我对某个功能有需求的时候，一想这个需求应该很多人都有啊，再一查多半是有人已经做出了这个功能。因为这个原因，zotero可以实现很多神奇的功能，比我之前用的Endnote方便许多。

zotero的界面

这个界面看起来很基础，以下的插件让zotero连升十级：

Zotfile

Zotero有一个非常大的缺点，就是不会自动把下载的文献添加到Zotero中。Zotfile这个插件则解决了这个问题。安装Zotfile插件后，用户可以指定一个source folder，这个文件夹中新增的pdf会自动导入到Zotero，并且被自动移动到指定文件夹中，用自定义的格式将pdf自动重命名。当我把文献从Endnote导出来的时候发现一个大问题。我的文献虽然在Endnote中分门别类整理好（Endnote中叫做group），但是这个信息却无法导出，虽然Bibliography可以方便地在文献管理的软件之间导入导出，但是只能形成一个长长的文献目录。而且pdf文件也全部存在Endnote下一个大文件夹中，没有下级文件夹。这意味着，我费时费力做的整理工作全都要从头来一次。唯一的办法是Endnote导出的时候每次选定一个文件夹，挨个转移到Zotero中。我在Endnote中一共建了十多个group，虽然最后还是用挨个转移的笨办法把我的分类信息保留了下来，但这个经历着实让我后怕。因此，我决定这次一定要把文件分类信息保存下来，pdf也要放在不同的subfolder中。这个截图中是我设定的source folder（也就是我下文献的时候的下载位置）和想要放pdf的文件夹。

截图中“Use subfolder defined by”我设定的是“/%c/”，即根据zotero图书馆中的文献分类来将pdf放在不同的下级文件夹。这个设定也可改成根据作者、发表年份等等来组织下级文件夹。

Zotfile另一个功能是抓取pdf中的笔记，生成一个文档，这个文档在Zotero中也是可以搜索的。这就意味着，看文献pdf时的勾画、批注都可以直接变成一个文本格式的笔记，不用为了一句记不清来源的经典句子翻遍文献啦。

生成文献笔记

Zotfile插件生成的文献笔记。每一条笔记后面蓝色部分都是超链接，直接复制粘贴到别的地方，点开可以直接跳到这一条笔记。我的思维导图中就有很多这样的引用，直接把我带到源文献。

在不同电脑上同步Zotero

1. 注册Zotero账号，同一个账号下文献目录自动同步。Zotero账号的免费储存空间只有300M，因此附件不能通过账号同步。

2. 文献附件可以付费升级Zotero储存空间，或者用另外的云盘来同步。我习惯用OneDrive来储存文件，包括文献附件，所以每台电脑上只需要在Zotero中设置文献位置，让Zotero找到文献附件就可以。

在Zotero中Edit>Preferences>Advanced>Files and Folders设置附件路径。Base directory是文献附件储存的位置（之前在ZotFile中，我设置了把文献储存到这个位置）。Data Directory Location是Zotero虚拟链接、文献目录等自动生成文件储存的位置，因为文献目录已经保存在Zotero账号上了，自动生成文件就不需要在不同电脑上同步了。

这个位置跟上图中ZotFile Preferences>Location of Files一致

RTF/ODF Scan plugin

这个插件吧，其实它的原理我不太懂，只知道安了之后可以把文献直接拖到freeplane、word、PowerPoint里面，成为一个超链接，点一下就可以打开pdf。我在思维导图中插源文献必不可少的工具！

设置RTF/ODF Scan，使pdf可以直接拖拽到freeplane中  

Freeplane+Zotero这个组合是我强烈推荐的科研工具，有心的朋友可以耐着性子研究一下，学习周期是一定会需要的。软件下好之后具体怎么配置、具体怎么操作就不细说了，科学上网用英文可以查到。