··· shell
wget http://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/2.10.0/sratoolkit.2.10.0-ubuntu64.tar.gz
解压软件
```shell
tar xzvf sratoolkit.2.10.0-ubuntu64.tar.gz
转到这个目录下，并查看里面的文件
cd sratoolkit.2.10.0-ubuntu64
打开程序所在目录
cd bin
配置环境变量
echo "export PATH=\$PATH:\$HOME/local/app/sratoolkit.2.10.0-ubuntu64/bin" >> ~/.bashrc
source ~/.bashrc
转到 lecture 文件夹下
mkdir -p ~/edu/lec4
cd ~/edu/lec4
建立prefetch命令
sudo apt install sra-toolkit
获取文件
prefetch SRR1553610
文件存储位置
ls ~/ncbi
使用find工具查看
find ~ncbi
cat *.fastq | grep @SRR | wc -l
