用vcf2maf批量把vcf转化成maf文件，使用的是本人写的pipeline，会自动记录哪些步骤已run，中断后重新开始不需要再run。
通过多进程方法，能同时运行多个pipeline，还能提示一个步骤运行了多少时间。
因为挂新硬盘的原因，关机挂载硬盘，转移数据，重新运行脚本，按理说在关机前被中断的5个vcf2maf过程会重新开始，然而发现这5个vcf2maf的时间显著低于前面样本同步骤，且生成的maf大小明显偏低。
关机，挂硬盘折腾了一番，仍然如此，头大。
后来想着干脆全部样本重新跑试试 ，作备份时，把待转的vcf文件目录下，在vcf2maf过程中由vep生成的vep.vcf文件全部转移掉，再怀着试一试的想法重新运行vcf2maf，发现时间应该正常了！！
猜想：可能是vcf2maf调用 vep前，如果检测到同目录下有vcf文件对应的vep.vcf文件，就认为已经完成vep注释过程，vcf2maf会直接从vep.vcf文件转成maf文件。起初被中断的5个样本，并没有完成相应的vep注释就直接进入生成maf过程，从而出现一开始描述的问题。
解决方法:及时把生成的vep.vcf文件转移或删除
