见课程二
1. Mac上的linux
不需要安装任何东西，自带terminal，直接使用；或者使用界面更好看的iterms
- iterms 是需要安装的，见教程 https://www.cnblogs.com/xishuai/p/mac-iterm2.html
2. 云服务器上的linux
学习小组统一使用豆花提供的免费腾讯云服务器
账号密码在邮箱（1核2G，仅供练习使用，能带领你熟悉linux命令行；另外这个的有效期有一周，足够大家熟悉linux的了）
2.1 登陆
mac 直接在terminal页面操作
步骤：（1）打开mac终端（terminal）；（2）ssh 用户名@ip地址
例如：ssh bio03@120.110.xxx，具体以邮件为准。
1574385458.4678.80905.gif
图片来源：https://m.umu.cn/session/article/2jzz3cb26
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打开mac终端：
image.png -
输入“ssh 用户名@ip地址”
终端登录失败-1.gif 回答“yes”
我的理解：将'122.51.158.112' (ECDSA)永久添加到已知主机列表中。就是说已经将这个添加到主机了，后面便可以直接登录。
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关闭终端后再登录的界面：
image.png -
再次输入用户名与IP地址：
image.png
(可能为了截图，输入了多次，才导致变成这样，重新输入用户名和密码)
不知道这样是不是就是完成登录了？
问题一：登录linux系统的服务器后，是不是在电脑里找不着摸不到啊？（是不是linux相关文件不能在电脑的文件夹中找到？）
总结：
2.2 学习linux命令
（1）pwd命令
pwd是Print Working Directory的缩写，其功能是显示当前所在工作目录的全路径。主要用在当不确定当前所在位置时，通过pwd来查看当前目录的绝对路径。[1]
- 实例一：用 pwd 命令查看默认工作目录的完整路径[2]
命令：
pwd
问题二：这个显示的目录指的是：当前linux系统工作目录吗？
(2)mkdir命令
mkdir是make directory的缩写-- 创建空目录。
mkdir 命令的功能是创建一个或多个新的目录。
- 实例1：创建目录
注：#后面是注释，就是解释代码的文字。
命令：
mkdir biosoft #存放生信软件
mkdir project #存放生信项目
mkdir tmp #存放其他未分类
mkdir src #存放源代码
问题三：这样就行了吗？
（3）ls命令
ls显示列表，不管是目录还是文件，都能显示。
- 实例一：
命令：
ls
（4）rm命令
删除的操作对象分为三类：普通文件、空目录、有内容的目录。他们的对应的命令是略有不同的。
（1）删除文件--rm
（2）删除空目录--rmdir
（3）删除非空目录--rm -r
注意这三个命令后面都要跟上你要删除的目录名。
另外，第三个命令可以改进，就是有点危险，曾有新闻，程序员（当然是权限比较高的那种）不慎用了这个命令，直接导致公司破产，因为公司服务器被清空了啥都没了！！！
这个可怕的命令就是rm-rf（别手欠要试试啊）
-r 递归，多级目录一并删除
-f 强制删除，不用任何提示
所以如果rm -rf后面不加目录名，就死定了，删除你服务器的所有东西。
来自花花的警告
- 实例一：
命令:
rmdir tmp
输出：
说明：第一次输入了rm tmp，然而rm是删除文件的意思，rmdir tmp才是删除空文件夹。
（5）cd命令
cd接一个目录名，表示进入该目录
cd -返回刚才的目录（就像电视遥控器上的返回按键，按一下快速换回刚才的台；如果你不知道，可能好久没看电视了）
主目录（家目录）：直接cd ，效果与cd ~ 一致
- 练习cd操作：进入tmp目录，然后查看当前路径，然后返回主目录
image.png
-
练习删除操作：
删除doodle.txt
删除整个huahua目录
删除rm_test(已经是空目录了)- 命令：
mkdir rm_test
cd rm_test
touch doodle.txt #touch是正经的新建命令，但是不如vi好使，vi是直接新建并打开编辑。
mkdir huahua
cd huahua
touch haha.txt
输出：
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删除doodle.txt
image.png -
删除整个huahua目录
image.png -
删除rm_test
image.png
（6）vi命令
vi 是新建脚本或者文本文档（vi是linux中的文本编辑器）
一看就会|90s小视频带你学习linux下的vi文本编辑器
练习：在“tmp”目录下新建一个名为“hello_linux”的txt文本，里面的内容为：
Today's "Linux system" class was a bit difficult for me.
I've heard of Linux before.
But I don't know anything about it.
There is a harvest today.
Thank the teachers for your efforts.
vi hello_linux.txt
(7) cat命令
cat接文本文件的名字，查看并直接将文本文件的内容输出到屏幕。要退出cat，是摁一下q。否则下面的命令都没办法运行。
head 默认输出前10行，tail默认输出后10行，后面加上-n 自定义输出几行
例如：head -n 3 hello_world.txt 【注意-n与head之间有空格，-n和3之间空格可有可无】
练习： 查看刚才自己的文件
来源：https://m.umu.cn/session/article/2jzz3cb26
cat hello_linux.txt
（8）cp命令
意为复制文件
使用：cp file1 file2
就是复制file1，命名为file2的意思。
来源：https://m.umu.cn/session/article/2jzz3cb26
练习：将刚才新建的文件复制一个，叫做new_file.txt
cp hello_linux.txt new_file.txt
（9）mv命令
mv 将文件移入文件夹，或者重命名
Linux mv 命令用来为文件或目录改名、或将文件或目录移入其它位置。
使用：mv file 路径是移动file到某路径下
使用：mv file1 file2是将file1重命名为file2
练习：将新文件new_file.txt，重命名为home.txt ，移动到主目录下（路径是～）
- 练习一：将新文件new_file.txt，重命名为home.txt
mv new_file.txt home.txt #(一个空格)
mv home.txt home_1.txt #(两个空格)
- 练习二：将home_1.txt移动到主目录"~"下
mv home_1.txt ~/
总结：
