1、将表格文件读入R语言，成为数据框

read.csv () –通常读取CSV格式
read.table() –通常用于读取txt格式

2、将数据框导出表格文件：

• csv格式：write.csv(x, file = "foo.csv")

  • x可能是矩阵或者数据框
  • "foo.csv"是文件名

• txt格式： write.table()

  • write.table(test,file = “excample.txt” )

3、R特有的数据格式： Rdata

- 是R语言特有的数据存储格式，无法用其他软件打开
- 保存的是变量，不是表格文件
- save（） 保存—load（） 加载
- save(test,file = “example.Rdata” )
- load(“example.Rdata” )

Rproject的组织形式：

• 脚本(.R)
• 数据（.Rdata)，
• 表格（.txt或.csv）

4、常见报错：找不到文件

找不到文件.png

解决：

• 原因1：文件没有存放于工作目录下
  （Rproject）
• 原因2：拼写错误
  （用tab自动补齐）

• 练习

1. 读取complete_set.txt（已保存在工作目录）

> x=read.table("complete_set.txt")
> head(x)
                  V1                  V2                 V3
1              geneA               geneB              geneC
2 -0.635020187971398   -0.49728008811353  0.514896730700242
3   0.91605661780324  -0.545381308500589   1.20238322656491
4  0.805995294157758  -0.315914513323816   0.27825197143441
5  0.538008107104279 -0.0673921064676487 -0.623764802577221
6   1.03110520787851   0.868414824317706  -1.61616345430907

2.查看有多少行、多少列

> ncol(x)
[1] 20
> nrow(x)
[1] 51

3.获取行名和列名

> rownames(x)
 [1] "1"  "2"  "3"  "4"  "5"  "6"  "7"  "8"  "9"  "10" "11" "12" "13"
[14] "14" "15" "16" "17" "18" "19" "20" "21" "22" "23" "24" "25" "26"
[27] "27" "28" "29" "30" "31" "32" "33" "34" "35" "36" "37" "38" "39"
[40] "40" "41" "42" "43" "44" "45" "46" "47" "48" "49" "50" "51"
> colnames(x)
 [1] "V1"  "V2"  "V3"  "V4"  "V5"  "V6"  "V7"  "V8"  "V9"  "V10" "V11"
[12] "V12" "V13" "V14" "V15" "V16" "V17" "V18" "V19" "V20"

4.导出为csv格式

> y=read.csv("gene.csv")
> y
   gene     sam exp
1 gene1 sample1  32
2 gene2 sample2  34
3 gene3 sample3  45
> write.csv(y,"lianxi4")

5.保存为Rdata

> save(y,file = "lianxi5.Rdata")

6.加载class.Rdata，查看每一列的数据类型

> load("G:/生信技能树-长沙/2、三天生信实际讲课/1、第一天上课/Day1-R/01-get_start/lianxi5.Rdata")