解析csv、tsv文件.md

解析tsv文件

tsv和csv都是以纯文本文件存储的电子表格格式

  • TSV：tab separated values；即“制表符分隔值”，用制表符分隔数据

  • CSV： comma separated values；即“逗号分隔值”，用逗号分隔数据

所以tsv文件可以用python的csv模块进行解析，只需指定分隔符即可。
参考csv

读取tsv文件

import csv

infile = r'./all_gene_disease_pmid_associations.tsv'
with open(infile, encoding='utf-8', newline='') as f:
        reader = csv.reader(f, delimiter='\t')
        # 返回一个列表的迭代，每一行都是一个列表
        for row in reader:
            print(row)
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