DAY6 一直不爱说话的耗子

安装和加载R包

1.镜像设置

最简单的方法,对于初学者最好的方式,虽然有局限性,但是简单易懂。


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2.安装

一定要连接互联网

install.packages(“包”)或者BiocManager::install(“包”)都可以安装。由你要安装的包存在于CRAN网站还是Biocductor决定。

3.加载

library(包)或者require(包)

安装加载三部曲

options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) 
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") 
install.packages("dplyr")
library(dplyr)

dplyr五个基础函数

1.mutate(),新增列

2.select(),按列筛选

3.filter(), 筛选行

4.arrange(),按某1列或某几列对整个表格进行排序

5.summarise():汇总

对数据进行汇总操作,结合group_by使用实用性强

dplyr两个实用技能

1:管道操作 %>% (cmd/ctr + shift + M)

2:count统计某列的unique值 count(test,Species)

dplyr处理关系数据

即将2个表进行连接,注意:不要引入factor

1.內连inner_join(test1, test2, by = "x"),取交集

2.左连left_join(test1, test2, by = 'x')

3.全连full_join( test1, test2, by = 'x')

4.半连接:返回能够与y表匹配的x表所有记录semi_join(x = test1, y = test2, by = 'x')

5.反连接:返回无法与y表匹配的x表的所记录anti_join

anti_join(x = test2, y = test1, by = 'x')

6.简单合并bind_rows()函数需要两个表格列数相同,bind_cols()函数需要两个数据框有相同的行数

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