安装和加载R包
1.镜像设置
最简单的方法,对于初学者最好的方式,虽然有局限性,但是简单易懂。
2.安装
一定要连接互联网
install.packages(“包”)
或者BiocManager::install(“包”)
都可以安装。由你要安装的包存在于CRAN网站还是Biocductor决定。
3.加载
library(包)
或者require(包)
安装加载三部曲
options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")
install.packages("dplyr")
library(dplyr)
dplyr五个基础函数
1.mutate()
,新增列
2.select()
,按列筛选
3.filter()
, 筛选行
4.arrange()
,按某1列或某几列对整个表格进行排序
5.summarise()
:汇总
对数据进行汇总操作,结合group_by使用实用性强
dplyr两个实用技能
1:管道操作 %>% (cmd/ctr + shift + M)
2:count统计某列的unique值 count(test,Species)
dplyr处理关系数据
即将2个表进行连接,注意:不要引入factor
1.內连inner_join(test1, test2, by = "x")
,取交集
2.左连left_join(test1, test2, by = 'x')
3.全连full_join( test1, test2, by = 'x')
4.半连接:返回能够与y表匹配的x表所有记录semi_join(x = test1, y = test2, by = 'x')
5.反连接:返回无法与y表匹配的x表的所记录anti_join
anti_join(x = test2, y = test1, by = 'x')