做转录调控,少不了这几个工具网站

关于转录调控的科研网站,我找到了几个有用的资源:

灯塔索引(dotaindex):整合了全部转录调控相关的网站,可以搜转录因子,可以搜结合位点。同时还包含泛素化修饰,rna调控等多个网站,方便快捷。

TRRUST:转录因子调控网络专用数据库:这是一个专注于人类和小鼠转录因子及其靶基因的可信关系数据库。它提供了丰富的数据资源,有助于转录调控相关的研究。

PlantRegMap:植物转录调控网络数据平台:由北京大学蛋白质与植物基因研究国家重点实验室高歌研究员课题组开发,提供了关于植物转录因子和转录调控的数据与分析平台。该平台包含转录因子结合位点预测、转录调控预测与富集分析等工具,涉及165个植物物种。

PlantTFDB:植物转录因子数据库:提供了关于植物转录因子的家族分类规则、基因组转录因子全谱、丰富的注释等信息,覆盖了拟南芥、水稻、杨树、大豆、玉米、小麦等165个物种。

Ensembl:由欧洲生物信息学研究所和英国桑格研究院合作开发的Ensembl数据库,支持比较基因组学、进化、序列变异和转录调控的研究。该数据库提供了广泛的工具和资源,用于探索基因序列和转录调控。

TransmiR 3.0:转录因子-miRNA调控更新数据库:专注于miRNA及其调控网络的研究,提供了丰富的TF-miRNA调控关系和详细注释,涉及29个物种。

这些网站提供了丰富的资源和工具,可以帮助您在转录调控研究领域取得进展。

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