学习小组Day7笔记--张坚涛

测序原理

一代测序

二代测序-adapter
二代测序


构建文库

在建库过程中,文库中每个DNA短片段的正链与反链都加上了P5与P7,因此建库后每个DNA片段都会扩增出两种结果(详见上面插图),如果全部上机,最终两条链都会有测序结果。因为上机测序起始是以DNA单链为单位,单链化的DNA片段进入测序仪流通池,会随机的结合在不同位置,且相互距离足够远以保证测序信号的独立读取。最终获得的测序结果会有重复的reads(反向互补也会有重复),所以都会有去重步骤,而且测序量越大重复率会越高。

二代测序

常用数据格式简介

Fastq & Fasta和GenBank & EMBL

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