世和基因泛癌早筛最新结果

前面已经介绍了关于世和基因泛癌早筛的技术路线及相关结果(国内泛癌早筛产品梳理之低深度全基因测序篇)。此次世和在AACR上一次发表了三篇关于泛癌早筛的Poster(第三篇评估实验的稳定性,在此不做介绍)。此次世和将只覆盖三个癌种的版本扩充到了13个,并同时发表了13个癌种版本的建模阶段的case-control结果大规模前瞻性验证的结果。

世和.png

首先介绍其建模阶段的结果:训练集样本:3076癌症 VS 3477健康对照,独立验证集样本:732癌症 VS 733非癌症对照。在独立验证集中,97.8%的特异性下可以达到87.4%敏感性,其中I期癌症敏感性76.9%,二期癌症敏感性84%,三期癌症敏感性92.3%,四期癌症敏感性97.1%,比越南Gene solutions公司的结果更好(在97%的特异性下可以达到72.4%的敏感性,参考越南也有泛癌早筛!!并且还不差!!)。组织溯源评估只纳入了癌种数目超过100的10个癌种,准确率可以达到83.5%,也比越南的结果更好(78%)。
建模阶段性能再好,大规模人群筛查中表现差的话也白瞎。。。那么世和13个版本的产品在大规模人群中表现如何:前瞻性纳入了3724个样本,后续有29个样本被诊断为了癌症,其中有8个患者未在13个目标癌种中,但是其后续并未去除这8个样本。早期(Stage I/II)患者达到了26个。29个癌症患者中,检测阳性的患者数目为16个,漏检了13个,整体敏感性达到55.2%,其中I期敏感性47.6%(10/21),二期敏感性80% (4/5),三期敏感性 66.7 (2/3)。组织溯源准确率只有61.5%。整体的特异性为97.9%(3619/3695)。算了一下PPV只有17.4% (16/92),就是说其检测阳性的患者只有不到1/5的几率才真正患有癌症, NPV为99.6%(3619/3632)。

总结:

世和此次的13个癌种的泛癌早筛产品,单独看建模阶段的结果要远远好于使用相同路线的其他产品,但是其在大规模前瞻性验证中的性能远远达不到建模时的效果,就是说模型过拟合了。鉴于这达不到预期的性能,估计其才加了一个“Interim(临时)”。。期待后续。。

©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 215,634评论 6 497
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 91,951评论 3 391
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 161,427评论 0 351
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 57,770评论 1 290
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 66,835评论 6 388
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 50,799评论 1 294
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 39,768评论 3 416
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 38,544评论 0 271
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 44,979评论 1 308
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 37,271评论 2 331
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 39,427评论 1 345
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 35,121评论 5 340
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 40,756评论 3 324
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 31,375评论 0 21
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 32,579评论 1 268
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 47,410评论 2 368
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 44,315评论 2 352

推荐阅读更多精彩内容