1.问题发现

在Liunx上敲入命令，跑RNA-seq pipeline

$ nohup bash RNA_seq_code.sh &

结果显示

: command not found
: No such file or directory public/home/one/two/three
'RNA_seq_code.sh: line 8: syntax error near unexpeted token 'do
'RNA_seq_code.sh: line 8: `do

2.问题解决

百度搜索发现：
windows里写的shell脚本放到linux系统里运行就会提示上述错误

syntax error near unexpected token `...

原因是两个平台下面的换行符不一样。所以需要在notepad++转换格式。

3.解决办法

1.打开notepad++，让脚本显示所有符号，会发现每行后面多了个CRLF

2.点击菜单栏编辑选项，再点击档案格式转换现在的版本是：文件格式转换，点击转换为UNIX格式：现在的版本是：转为Unix（LF）

3.所有行后面的换行符转换为了LF

4.然后保存shell脚本，在Linux上运行脚本，显示成功。

参考网页：https://jingyan.baidu.com/article/9f63fb91d014b8c8410f0e7a.html
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