10. 2019-02-18 计算

1. mean(x, trim=percent, na.rm=), median(x, na.rm=), mode

mode 一组数据出现最多的值,可以是字符

2. 回归:建立模型

(1)线性回归

y = ax + b #x预测变量,y响应变量

逻辑:收集数据,lim()创建关系模型,找到系数,获取残差/平均误差(找summary),predict()运用,绘图plot(y,x,abline(lm(x~y)), col, main...) 

tip: ~因变量与自变量

predict(function, data.frame(number))

#Error in int_abline

格式书写错误

解决:原本plot(y,x,abline(lm(x~y)),type="b") 变成 按照上述格式。

(2)多重回归

y = a + b1x1 + b2x2 +...bnxn

lm(y ~ x1+x2+x3...,data)

coef(function)[position] #得系数,系数位置可通过print(function)查阅

3)逻辑回归

y = 1/(1+e^-(a+b1x1+b2x2+b3x3+...)

概念

函数:glm()

(4)泊松回归

假设响应变量泊松分布;对数-线性模型

log(y) = a + b1x1 + b2x2 + bnxn.....

函数:glm(formula=, data, family=poisson) #formula为变量间关系y~x1+x2

(5)非线性最小二乘回归

寻找拟合的参数系数

模型:a = b1*x^2+b2

函数nls(formula, data, start) #formula假设的关系,start 数字列表或者数字向量

nls后直接print和参考方式不太一样


3. 标准分布与二项分布:概率问题

(1)标准分布

dnorm(x, mean, sd) #x seq(num1,num2,by = num3)num1 to num2 increase by num3 y轴为概率

pnorm(x, mean, sd) #累积分布函数,y轴累积概率

qnorm(p, mean, sd) #累积分布函数,x轴累计概率

rnorm(n, mean, sd) #输入样本数,随机产生分布,hist直方图显示

(2)二项分布

理解:硬币为例

dbinom(x,size,prob) #每个次数的概率

pbinom(x,size,prob) #单个值的概率

qbinorm(p, size, prob) #概率的单个累计值

rbinorm(n, size, prob) #n给定样本数量给定概率的随机值


4. 分析

(1)协方差分析ANCOVA

有两个因素左右因变量,不感兴趣或者不重要的因素称为协变量,为分类型变量,另外一种为连续型变量

关键在于方差分析,线性回归仅作为不可剔除的关系

逻辑:研究协变量的值对回归的影响

函数:

aov(y~x*z,data) #x为预测变量,y为响应变量,研究xz相互作用;响应变量在前

anova(function) #function should be lm() OR glm()比较两个模型看变量间的相互作用是否重要

如图:


ANOVA分析

(2)时间序列分析

函数:timeseries.object.name <- ts(data, start, end, frequency) #frequency=12月份,6每小时10分钟,4季度,24*6一天的每10分钟

修改:多时间序列

逻辑:两组合成matrix,注意nrow而非ncol,ts()转化为时间序列而非“先各自ts然后再组合”

#start的日期格式

help里说的很清楚:single number或者a vector of two integers

(3)生存分析

安装“survival”包

加载

函数:

Surv(time, event) #event "frame$status=="

survival(formula) #analysis of Surv and what

REF:https://baike.baidu.com/item/%E5%8D%8F%E6%96%B9%E5%B7%AE%E5%88%86%E6%9E%90/5366621?fr=aladdin

(4)卡方检验

VS ANOVA分析:确定两分类变量是否存在显著相关性


函数:chiseq() #里面为含变量的表格形式数据 用table()函数

卡方检验


4. 决策树和随机森林

(1)决策树

预测模型

例子:预测肿瘤癌变,预测电子邮件是否垃圾邮件,预测风险因素。

下载安装包"party"

加载

head() #查看变量名称

函数:ctree(formula,data) #data数据集


(2)随机森林算法

创建大量决策树,输出每个观察的最多结果。多数投票

包:randomForest

加载party包

函数:randomForest(formula, data) #创建和编辑,语法和决策树一样

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