单细胞108篇文献解读之9---Single-cell analysis reveals transcriptomic remodellings in distinct cell types t...

上海长海医院任善成与加拿大多伦多大学何厚胜和复旦大学附属肿瘤医院王建华合作在Nature Cell Biology(IF 20.042)发表前列腺癌肿瘤微环境的动态重组最新研究成果“Single-cell analysis reveals transcriptomic remodellings in distinct cell types that contribute to human prostate cancer progression”,该研究阐明了肿瘤微环境中多种与疾病进展相关的细胞亚群和转录水平改变,对治疗靶点的确定和侵袭性肿瘤生物标记物的开发提供思路。

image

研究思路及主要结论
背景

前列腺癌是世界范围内男性发病率第二位的恶性肿瘤。前列腺癌具有很强的临床异质性,部分可迅速发生骨、淋巴结转移等,是前列腺癌患者死亡的主要原因。前列腺癌显著的临床异质性,表现为空间和克隆基因组的多样性。相比之下,对前列腺肿瘤转录组的异质性了解甚少,截至目前尚未有研究进行系统全面地阐述。

研究****结果

01

单细胞转录组绘制前列腺癌图谱

对12名患者的13个组织样本(12例前列腺癌原发灶和1例前列腺癌淋巴结转移灶)进行单细胞转录组测序,共获得36,424个细胞的转录数据,注释为20个细胞亚群,包括上皮细胞、成纤维细胞、单核-巨噬细胞系、内皮细胞、肥大细胞、T细胞等主要的细胞群体。

image

02

前列腺癌上皮细胞亚群分析

对上皮细胞亚群进行进一步的分群得到16个亚群。发现上皮细胞亚群(Cluster 10),其分子特征与前列腺癌较好的预后相关,并特异性表达转录因子CCL2,另一个上皮细胞亚群(Cluster 12),处于有丝分裂G2/M期,其分子特征与前列腺癌患者的预后呈负相关。多个公共数据库也验证了两种分子分型与前列腺癌患者预后相关。

image

03

浸润的CD8+效应T细胞表达肿瘤标记基因

进一步分析前列腺癌内T细胞,发现在一个调节性T细胞亚群和两个效应T细胞亚群中特异性表达前列腺癌的临床标记物KLK3基因。效应T细胞的细胞外囊泡和外泌体通路被激活,推测肿瘤分泌的囊泡介导KLK3转移至T细胞,而原位杂交和免疫荧光验证了该结论。分析了四种额外癌症数据库:头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)、非小细胞肺癌(NSCLC)、结肠直肠癌(CRC)和肝细胞癌(HCC)。在所有四种癌症类型中都发现了T细胞中肿瘤标记基因的表达,表明这可能是浸润性T细胞转录组的一般特征。

image

04

激活的内皮细胞提高前列腺癌侵袭能力

进一步分析内皮细胞(EC),发现一类高表达肿瘤相关成纤维细胞的特征基因,命名为激活的内皮细胞(aECs)。对6个前列腺组织和5个来源于CRPC患者的肿瘤样本进行单细胞测序,拟时序分析发现aEC的比例随肿瘤进展逐步升高,与前列腺癌进展密切相关。流式分选及体外实验发现aEC细胞亚群能够提高前列腺癌细胞的侵袭能力,说明aEC在前列腺癌发生发展过程中起着重要的作用。

image

研究****结论

该研究通过对前列腺癌进行单细胞测序分析,确定了疾病侵袭性的上皮细胞。肿瘤微环境显示了多个进展相关转录组程序的激活。验证了癌细胞具有改变T细胞转录组的能力。发现一个内皮亚群,与肿瘤细胞活跃有关,可促进癌细胞的侵袭。该项研究对前列腺癌新型治疗策略和肿瘤生物标记物的开发具有重大价值。

作者:博奥晶典
链接:https://www.jianshu.com/p/c728ed8b02d2

©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 215,794评论 6 498
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 92,050评论 3 391
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 161,587评论 0 351
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 57,861评论 1 290
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 66,901评论 6 388
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 50,898评论 1 295
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 39,832评论 3 416
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 38,617评论 0 271
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 45,077评论 1 308
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 37,349评论 2 331
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 39,483评论 1 345
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 35,199评论 5 341
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 40,824评论 3 325
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 31,442评论 0 21
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 32,632评论 1 268
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 47,474评论 2 368
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 44,393评论 2 352

推荐阅读更多精彩内容