学习R包
思维导图day6.png
R包是多个函数的集合。以下以dplyr为例。
一、安装和加载R包
1.镜像设置
初始配置.jpg
file.edit('~/.Rprofile')
options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) #对应清华源
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") #对应中科大源
options()$repos options()$BioC_mirror检验
2.安装
install.packages(“包”)orBiocManager::install(“包”)
3.加载
library(包)or require(包)
二、dplyr五个基础函数
示例数据 test <- iris[c(1:2,51:52,101:102),]
1.mutate(),新增列
mutate(test, new = Sepal.Length * Sepal.Width)
mutate.png
2.select(),按列筛选
按列号筛选
列号.png
按列名筛选
列名.png
3.filter()筛选行
筛选行.png
4.arrange(),按某1列或某几列对整个表格进行排序
arrange(test, Sepal.Length)#默认从小到大排序
arrange(test, desc(Sepal.Length))#用desc从大到小
从小到大.png
从大到小.png
5.summarise()：汇总
summarise(test, mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))# 计算Sepal.Length的平均值和标准差
group_by(test, Species)
summarise(group_by(test, Species),mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))
summarise.png
三、dplyr两个实用技能
1.管道操作 %>% (cmd/ctr + shift + M)
（加载任意一个tidyverse包即可用管道符号）
test %>%
group_by(Species) %>%
summarise(mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))
管道操作.png
2.count统计某列的unique值
count(test,Species)
count.png
四、dplyr处理关系数据
两表连接
options(stringsAsFactors = F)
test1 <- data.frame(x = c('b','e','f','x'),
z = c("A","B","C",'D'),
stringsAsFactors = F)
test1
test2 <- data.frame(x = c('a','b','c','d','e','f'),
y = c(1,2,3,4,5,6),
stringsAsFactors = F)
test2
两表连接.png
1.內连inner_join,取交集
inner_join(test1, test2, by = "x")
inner_join.png
2.左连left_join
left_join(test1, test2, by = 'x')
left_join(test2, test1, by = 'x')
left_join.png
3.全连full_join
full_join( test1, test2, by = 'x')
full_join.png
4.半连接：返回能够与y表匹配的x表所有记录semi_join
semi_join(x = test1, y = test2, by = 'x')
半.png
5.反连接：返回无法与y表匹配的x表的所记录anti_join
anti_join(x = test2, y = test1, by = 'x')
反.png
6.简单合并
在相当于base包里的cbind()函数和rbind()函数
bind_rows()函数需要两个表格列数相同
bind_cols()函数需要两个数据框行数相同
test1 <- data.frame(x = c(1,2,3,4), y = c(10,20,30,40))
test1
test2 <- data.frame(x = c(5,6), y = c(50,60))
test2
test3 <- data.frame(z = c(100,200,300,400))
test3
合并1.png
bind_rows(test1, test2)
bind_cols(test1, test3)
合并.png
