fMRIprep（一）数据获取

运行环境为Ubuntu22.04。
此笔记不包括docker以及fmriprep容器的安装（此部分可参考刘梦醒大佬的视频）。

docker的安装和使用_哔哩哔哩_bilibili

此笔记的内容来源于Andy‘s book，参考如下：

BIDS App Tutorial #2: fMRIPrep — Andy's Brain Book 1.0 documentation (andysbrainbook.readthedocs.io)

fMRIprep的数据必须整理成BIDS格式
可用此网址检验数据结构是否满足BIDS格式：

https://bids-standard.github.io/bids-validator/

练习数据来自Openneuro，地址如下：
注意版本为58016286cce88d0009a335df
Created: 2018-07-14

Flanker task (event-related) - OpenNeuro

将数据放入新建的flanker文件夹内，目录结构如下：

flanker
│  CHANGES
│  dataset_description.json
│  participants.tsv
│  README
│  T1w.json
│  task-flanker_bold.json
│
├─derivatives
│  ├─mriqc   
│         ...
│
├─sub-01
│  ├─anat
│  │      sub-01_T1w.nii.gz
│  │
│  └─func
│          sub-01_task-flanker_run-1_bold.nii.gz
│          sub-01_task-flanker_run-1_events.tsv
│          sub-01_task-flanker_run-2_bold.nii.gz
│          sub-01_task-flanker_run-2_events.tsv
│
├─sub-02
│  ├─anat
│  │      sub-02_T1w.nii.gz
│  │
│  └─func
│          sub-02_task-flanker_run-1_bold.nii.gz
│          sub-02_task-flanker_run-1_events.tsv
│          sub-02_task-flanker_run-2_bold.nii.gz
│          sub-02_task-flanker_run-2_events.tsv
...