2023-03-22 几个预测蛋白结构、理化性质的在线工具

1.预测理化性质：分子量(Da)、等电点(PI)\不稳定系数(Instability index)、亲水指数(Grand average of hydropathicity-简写GRAVY)、脂溶指数(Aliphatic index)

ProtParam tool (https://web.expasy.org/protparam/)

2.预测跨膜结构域

TMHMM Server v. 2.0 (http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/)

结果解读：http://www.genedenovo.com/news/582.html

3.预测信号肽

SignalP-5.0(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/)

结果解读：http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP-3.0/output.php

4.蛋白质亚细胞定位预测

BUSCA（http://busca.biocomp.unibo.it/）

5.预测二级结构

SOPMA (https://npsa-prabi.ibcp.fr/NPSA/npsa_sopma.html)

6.预测三级结构

SWISS-MODEL(https://swissmodel.expasy.org/)

I-TASSER(https://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/I-TASSER/)

phyre2(http://www.sbg.bio.ic.ac.uk/phyre2/html/page.cgi?id=index)

3dpssm(http://www.sbg.bio.ic.ac.uk/~3dpssm/index2.html)

©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
平台声明：文章内容（如有图片或视频亦包括在内）由作者上传并发布，文章内容仅代表作者本人观点，简书系信息发布平台，仅提供信息存储服务。

推荐阅读更多精彩内容