上次我是把bed bim fam 转成 vcf ，这次反过来，我已有的vcf 文件，要转成 bed bim fam.
上网查了查，发现plink1.9 和 plink2.0 都可以做,但也有可能我做的是不对的。。
先去官网下载安装好plink1.9 和 plink2.0， 可以参考这个https://www.jianshu.com/p/295fce0e82ce
准备好文件
一个vcf文件
先看plink1.9
plink --vcf Arab.vcf --allow-extra-chr --maf 0.05 --recode --out Arab
生成 map 和 ped
map 和 bed
接着下一步
plink --file Arab --maf 0.05 --allow-extra-chr --make-bed --out Arab
生成了 bed bim fam
OK
在来学习plink2
首先准备好一个文件
就是刚刚那个，我改了个名字
然后一个命令就可以
plink2 --vcf test.vcf --allow-extra-chr --make-bed --out test
OK，然后就生成了bed bim fam
可以接着分析了
