最近在看单细胞方面的文献（例如 The bone marrow microenvironment at single-cell resolution）时，总是时不时的出现流式细胞仪细胞术（FCM）的图，而在google搜索single cell的时候也总是出现流式细胞仪相关的介绍。那么流式细胞仪细胞术到底是什么？它对于我们做单细胞方面的研究到底有哪些帮助呢？我们到底怎样解读流式细胞仪的结果呢？这一切的答案都要求我们对流式细胞仪有一个基本的了解。
流式细胞仪的作用简单来说就是分选细胞（如下图）：
流式细胞术（FCM）是70年代发展起来的一种利用流式细胞仪快速精确对细胞等生物粒子的理化及生物学特性（细胞大小、DNA/RNA含量、细胞表面抗原表达等）进行定量分析和分选的新技术。
FCM在细胞生物学、肿瘤学、免疫学的单细胞水平的研究中其中重要的作用。那么我们先看看
1.检测淋巴细胞亚群，监测细胞免疫状态
例如仅仅根据fsc/ssc就可以区分外周血中的淋巴细胞,单核细胞,中性粒细胞.
免疫发生异常时，就能导致机体免疫紊乱并产生病理变化。FCM可以同时检测一种或几种淋巴细胞表面抗原，将不同的淋巴细胞亚群区分开来，并计算出它们相互间的比例，通过对病人淋巴细胞各亚群数量的测定来监控病人的免疫状态，并指导治疗）。
例如，通过对淋巴细胞流式检测，可以检测在不同条件下，各种类型细胞比例的变化。
比如用流式检测细胞凋亡～～～
流式细胞术的特点是：
1.检测对象：单细胞悬浮液或生物颗粒
2检测参数：多参数
3.检测特点：单细胞水平
4.检测速度：高速（上万个细胞/s）
5.检测结果：精度高，准确性好
知道了流式的特点，那么流式细胞仪检测细胞参数的原理都有哪些呢？
流式细胞仪根据细胞的特性，将光信号转变为电信号，最终转换为数字信号（如下图）
而光信号的核心在于，
前向散射光FSC和侧向散射光SSC，实验中常常采用FSC和SSC来区分细胞群体，并去除碎片，死细胞，粘连细胞的干扰。
那么再做流式或者看到文献中流式的结果时，坐标轴的意义是什么？我们如何解读？
FCM结果的显示通常有一维直方图、二维点图、等高线图、密度图等几种。由数据还可以做出标准曲线进行定量分析。
首先二维图：
在二维图的中，横坐标 / 纵坐标都表示荧光信号或散射光信号相对强度的值，可以是线形（line）或者对数（log）。双参数图可以将样品细胞群分开，从而方便对感兴趣的细胞进行分析。
其次单参数直方图
每一个细胞单参数的测量数据可以整理成统计分布，以直方图的方式来显示。在图中，横坐标表示荧光信号或散射光信号相对强度的值，其单位是道数（channel），可以是线形（line）或者对数（log）。纵坐标一般是相对细胞 / 粒子数（count）。
哈哈哈哈，写到这里，我已经对流式有了初步的认知，下次再看10X文献的时候，反正这块是不愁了.....
