简单了解conda
- 等于是一款方便快捷的软件下载器（app store）
在服务器中下载miniconda-先下载后安装
- miniconda = conda + python + base packages
安装和配置miniconda
- 1.在xshell中连接服务器，并在miniconda 清华镜像中，复制linux-64-bit版本的链接
- 2.进入biosoft目录，“cd b” + tab键，enter
- 3.调用wget命令，wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda-3.0.0-Linux-x86_64.sh，直接enter yes通过
- 4.安装miniconda：bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh ，enter/yes通过，直到“thank you for installing Miniconda3!”
- 5.一定要激活conda：source ~/.bashrc
- 6.添加镜像（清华镜像）
使用miniconda，查看已安装的软件、搜索、安装、卸载（生信需要的）软件，我们以fastqc为例
- 查看当前所有软件列表 conda list
- 搜索软件 conda search fastqc（以fastqc为例）
- 安装软件 conda install fastqc -y/conda install fastqc
-
卸载软件 conda remove fastqc -y
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