Garnett包用于注释单细胞数据所属细胞类型。
在按照官方步骤安装时候,出现下列错误:
** byte-compile and prepare package for lazy loading
Error: (converted from warning) package 'VGAM' was built under R version 3.6.2
Execution halted
ERROR: lazy loading failed for package 'garnett'
问题原因是:所安装的VGAM用的编译R环境与当前安装环境不一样。
解决方案:install.packages('VGAM',type='source')源码变异安装。
如果是Windows环境,需提前安装Rtools环境。