关键词
R包，dplyr （基础函数，实用技能，处理关系数据）
Tips
- R 包 —— 多个函数的集合，具有详细的说明和示例。（本次以 dplyr 为例）
-
Rstudio 最重要的两个配置文件：
（1）.Renviron # 设置 R 的环境变量
（2）.Rprofile # 代码文件（如果在启动时找到这个文件，就替我们先运行一遍
今日笔记
<一> 安装和加载R包
1. 镜像设置
（1）初级模式—— Rstudio→Tools 配置
初级模式
（2）升级模式—— options 函数
-
options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))# 对应清华源 -
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")# 对应中科大源 -
options()$repo/options()$BioC_mirror# 查看镜像
升级模式
（3）高级模式—— R的配置文件 ‘.Rprofile’
file.edit('~/.Rprofile')options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")
配置 .Rprofile
- ‘保存’ → ‘重启 Rstudio’ → ‘options’命令
运行
2. 安装
-
install.packages(" ")# 安装的包存于CRAN网站 -
BiocManager::install(" ")# 安装的包存于Biocductor - ！一直失败报错，后面检查发现IE浏览器不能上网，太狡猾了也= = 按网上的办法说要关闭代理服务器，我的设置里显示的就是关闭状态，一不做二不休我给打开又给关了就能用了...（人间疑惑 = =
报错 1 号
报错 2 号
报错 3 号
biu~终于运行下去了
3. 加载
- 使用
library( )/require( )命令
library()
- 操作中示例数据为内置数据集 iris 的简化版
test<- iris[c(1:2,51:52,101:102),]
<二> dplyr 五个基础函数
1. mutate() # 新增列
mutate()
2. select() # 按列筛选
（1）select（test，num） # 按列号筛选
（2）按列名筛选
3. filter() # 筛选行
filter()
4. arrange() # 按某一列或某几列对整个表格进行排序
-
arrange(test,Sepal.Length)# 默认从小到大排序
-
arrange(test,desc(Sepal.Length))# 用desc从大到小
- 两者组合
5. summarise( ): # 汇总（结合group_by使用实用性强
summarise( ):
<三> dplyr 两个实用技能
1. 管道操作
-
%>%(cmd/ctr + shift + M) - 加载任意一个 tidyverse 包即可用管道符号
管道操作
2. count命令统计某列的 unique 值
count
<四> dplyr 处理关系数据
- 将两个表进行连接（注：不要引入factor）
1. inner_join() # 内连, 取交集
inner_join()
2. left_join() # 左连
left_join()
3. full_join() # 全连
full_join()
4. semi_join() # 半连接（返回能够与y表匹配的x表所有记录
semi_join()
5. anti_join() # 反连接（返回无法与y表匹配的x表的所有记录
anti_join()
6. 简单合并
（1）bind_rows() # 按列数将行合并
bind_rows(test1,test2)
（2）bind_cols() # 按行数将列合并
bind_cols(test1,test3)
一句废话
眼神不好的人认真学习着实可以训练耐心...
