1 后记
应用统计学与R语言实现学习笔记这一系列博客断断续续写了5个月左右。现在终于算是基本完成了。我个人比较强迫症，比较喜欢一个系列更完再更其他的。所以中间有一些不错的内容想写到博客里都没动笔。后面会继续填坑。另外之后遇到的跟应用统计学与R语言实现相关的内容会以番外篇形式发布。
当时想到写这个东西，主要是自己选了门应用统计学的公选课，个人觉得不能浪费了这门课，而且其实我们在做一些研究的时候，其实都用了很多新的、高大上的所谓的新方法，并且不断在追逐所谓的Big data，但是回过头来想想，最基础的统计学理论可能才是我们需要补课的地方（不得不说这门课挺对我胃口，去年暑假花了一部分时间在啃贾俊平的统计学，刚好是这门课的参考教材）。这个年代，用个tensorflow的包，import一下，训练个模型出来就能说自己做的是深度学习。个人意见，也对也不对。IT技术飞速发展，大大降低了程序猿的门槛，但是现在的情况更应当说是程序猿的行当易学难精了。扯得有点远，总之我认为返璞归真地去学一学高数、概率论、统计学、线性代数可能比一上来就开始各种机器学习什么的要强得多。
这份笔记的定位，就是一份笔记，某些程度上就是课程老师给我们的ppt，我对理论部分做了整理。所以要归功于我的任课老师王老师。我不求大家从头到尾看完这份笔记，因为理论很枯燥，但是当需要用些什么内容的时候，可以想起这份笔记，供大家查找和参考。我的笔记并不像《深入浅出统计学》那样直白而又易懂的语言，尽管中间有一定的尝试，所以不可能看完我的这个系列博客就能对统计学的基本内容完全融会贯通，如果你希望在统计学上有所建树，需要大家自己去补课。另外我这部分更多针对于应用，而且基于我自己本身地学背景，我讲的例子也都跟尽量跟地学、生态相关。所以其他专业的同学会觉得一些例子苦涩难懂是比较正常的（在此向其他专业同学说声不好意思，你们的批评我虚心接受，但是你们这方面的建议我坚决不改，傲娇脸）。
好，讲了这么多。这个系列我其实是作为我自己的一个开源项目做的，我希望大家有什么意见可以一起来帮忙修改完善这个项目。如果你觉得还不错，也不要吝啬你的star。我博客里提到的很多代码之类的也都在这个项目里面开源了。就请大家批评指正。
Note-of-Applied-Statistics-with-R
2 基于gitbook的电子书生成教程
Modern book format and toolchain using Git and Markdown
这是 gitbook 项目主页上对 gitbook 的定义。
gitbook 首先是一个软件，正如上面定义的那样，它使用 Git 和 Markdown 来编排书本。
也可以使用gitbook editor。
gitbook可以与github关联，直接将仓库的markdown文档发布成电子书。为了方便管理，选择在github上搭建电子书整体内容，然后push到github上，同时同步到gitbook中。首先用github登录gitbook。接着在github上创建一个新的仓库。只保留markdown文档和文件夹。gitbook的关键是需要SUMMARY的markdown文档，这个文件是用来组织书的框架。如下图。
README的前言其实就是上面的后记，想说的话大体相同。只不过时间先后问题导致成了前言和后记。其他的是链接各章节。
接着看一下github上仓库项目结构（初步构成）。
因为在线渲染电子书速度较慢，我们可以在本地进行渲染和修改。目前只需将仓库先克隆到本地。接着安装gitbook（基于node.js）。
因为gitbook是基于node.js的，先查看是否安装了node.js。
node -v
npm -v
接着输入命令，安装gitbook。
npm install gitbook-cli -g
接下来在github上先安装gitbook的拓展应用。并选择应用的仓库范围（可以选择所有仓库，也可以只选择对应的仓库）
这样在gitbook上创建新书的时候，可以选择github的模板，直接导入书籍的仓库，并且后面可以自动同步。
在gitbook的setting中设置，默认生成pdf，mobi，epub的电子书供下载，选择MIT许可证。
gitbook可以通过book.json这个文件来控制生成电子书的一些具体定制化的需求。我的设置如下，因为用到了流程图和大量数学公式，就多加了katex和mermaid的插件。
首先通过命令行，定位到克隆到本地书籍的路径。
gitbook install
先安装插件。
接着渲染一下。
gitbook build
最后本地服务器运行。
gitbook serve
在浏览器网址输入localhost:4000。
即可查看。
执行gitbook build的时候可能会有各种报错，根据报错信息一个一个修改。目前发现似乎gitbook不太支持mathjax。而且公式里面不能有中文及中文标点符号，而且原来在博客上，两个$是表示数学符号，但是不是自己占一行。四个 $是表示独立的公式，必须另起一行。但是katex只认四个$。所以进行了一番较多修改，流程图目前也一直无法显示。mermaid跟我博客的流程图插件也不相同。我用的是flowchart，但是安装了似乎也不显示。最后就先用截图来表示了。
全部搞定后直接push到github上。
发现gitbook上没有完全同步。可以从setting里面设置。
OK，大工告成，接下来只需等它在线渲染成功就可以了。
PDF版本。
每每看到封面的熊本分分钟出戏。。。
在线网址访问网址：
应用统计学与R语言实现学习笔记
有兴趣的同学可以下载这本电子书，也可以在评论留邮箱，可以发送给大家。
参考博客：
