PlantCV说明文档

介绍

PlantCV 是应用于多种植物成像的功能模组。文档中将描述功能的使用方法以及如何在图像处理流程中应用。最初发布的PlantCV版本主要用来进行可见光（VIS）、近红外（NIR）以及激发荧光成像（PSII）的图像处理。PlantCV的开发还在不断迭代，我们希望得到更多植物表型组社区的助力。如有疑问或者建议，请在GitHub issues page上提问。

注：在丹佛斯研究中心我们对内一般用FLU代指激发荧光成像(PSII)。但之前有已发表文章中，使用FLU代指固定态荧光成像系统（另一种荧光成像）。我们正在将FLU替换为PSII来避免可能导致的误解。

开始

本文档可以使用侧边栏导航(官方网站)。PlantCV各项功能的说明文档在"Package plantcv" 和"Package plantcv.learn."目录下，对安装、升级和其他常见问题，见以下：

• 安装 PlantCV

• 更新 PlantCV

• 常见问题

• PlantCV 图像分析通用方法

• Jupyter Notebooks 使用 PlantCV

• 输出测量结果和数据库结构的总结

对于PlantCV的针对性教程如下：

• 可见光/RGB 图像处理

• 近红外图像处理

• 激发态荧光成像图像处理PSII

• 可见光/近红外双通道

• 多组植物图像处理

• 机器学习教程

• 并行图像处理

• 数据导出进行下一步处理

我们增加了以下交互式的文档（打开链接需要一定时间加载，请耐心等待），可以进行流程测试甚至上传自己的图像来测试。

点击查看交互式教程文档!

如果您有兴趣为PlancCV贡献一份力量，请点击：

• 贡献指南
• 文档指南
• 操作代码

版本

在 master 代码分支下latest 版本默认是最新的PlantCV说明文档。Documentation for all releases from v1.1版本以后的发布也可以在Read the Docs菜单查看。.

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