best reciprocal hit

做两个物种的ortholog

找两个物种的进化关系,如果距离远的话就把e值放大一些(根据文献)

BLAST

所谓BLAST既是:basic local alignment search tool 局部序列比对基本检索工具。

在NCBI上分为多种,常用的有N-BLAST(核苷酸序列比对检索)和P-BLAST(蛋白比对检索)。此外还有primer Blast等。

BLAST的作用顾名思义,就是用于各种核苷酸序列,蛋白质序列等在数据库内与已知数据的比对检索,可以找出相似的序列,用于蛋白质和核酸等的功能结构预测分析

最后编辑于
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
平台声明:文章内容(如有图片或视频亦包括在内)由作者上传并发布,文章内容仅代表作者本人观点,简书系信息发布平台,仅提供信息存储服务。

推荐阅读更多精彩内容