根据“干长根湿长芽”，也可以说“有氧长根，无氧长芽”的原理来进行种子的萌发。
种子萌发时，根和芽的生长是两种不同的方式：
1、根的生长：虽然有细胞的伸长，但主要靠细胞的分裂方式进行。细胞分裂需要大量的蛋白质等有机物供应，这些物质的转化参与合成新器官，又需要提供一些能量。没有充足的氧气供应，呼吸作用受到限制，细胞分裂不能进行，根也无法生长。
2、芽的生长主是胚芽鞘细胞的伸长，它没有新细胞的生成，只要有充足的水分，有氧无氧都可以进行，而且在无氧条件下伸长得更快，持续时间较长。
综上所述，水稻浸种时，先用40℃水浸泡一天（水温会慢慢变为室温），种子会经历由物理吸水到化学吸水的转变。接着用湿毛巾包裹种子，放到37℃培养箱中培养即可，第二天应该就能看到露白，接着第三天就能看到生长的根。
若要做种子的萌发实验，则在物理吸水12小时后开始做萌发统计了。
