期刊：Nucleic Acids Research
IF：16.6
发表时间：2024 Oct 18
文章简介：
本研究整合了包括单细胞转录组、空间转录组和表观遗传组的多组学数据，构建了一个涵盖人类与非人灵长类大脑的多组学时空数据库——MAPbrain（a Multi-omics Atlas of the Primate brain）。
样本策略：
整合了6个物种的三种组学数据，包括人类和五种非人灵长类动物，鉴定了161种细胞类型，覆盖灵长类大脑的38个脑区436个亚区，跨越164个发育时间点。
应用技术：scRNA-seq、snATAC-seq、空间转录组。
研究亮点：
(1) MAPbrain提供了对单细胞转录组学、空间转录组学以及表观遗传组学数据的多层级可视化探索。
(2) MAPbrain支持针对不同数据集之间进行三种关联比较分析：“Analysis-Compare”, “Analysis-Inter_Omics”和“Analysis-CellMapping”。
① 在“Analysis-Compare”模块中，可以选择两个不同的数据集，以查看它们在细胞类型构成和基因表达等多 方面的差异。
②“Analysis-Inter_Omics”模块可以对单细胞转录组学与表观遗传组学数据联合展示。
③“Analysis-CellMapping”模块包含细胞映射功能，支持数据上传，并与MAPbrain数据库进行整合。
研究意义：
本研究首次聚焦于灵长类脑发育的多组学数据的收录和整合，揭示了基因表达调控随脑发育成熟过程中的时空动态变化，并开发了交互式网页以供用户探索。
文献原文（DOI）：10.1093/nar/gkae911
