FastQC安装与质检

在官方网站下载 FastQC v0.11.8 (Win/Linux zip file)
http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/download.html#fastqc

将下载完的文件塞到你的目标文件夹中，打开终端，配置环境变量，这样你就能在任何一个文件夹下运行fastqc

echo "export PATH=$PATH:/Users/baiyunfan/bio/FastQC" >> ~/.bashrc
source ~/.bashrc

然后cd到你放数据的文件夹下

fastqc SRR2060752.fastq

会生成报告

报告的结果可在如下博客解读：
https://blog.csdn.net/gateswell/article/details/78858579

©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
【社区内容提示】社区部分内容疑似由AI辅助生成，浏览时请结合常识与多方信息审慎甄别。
平台声明：文章内容（如有图片或视频亦包括在内）由作者上传并发布，文章内容仅代表作者本人观点，简书系信息发布平台，仅提供信息存储服务。

相关阅读更多精彩内容

友情链接更多精彩内容