Apktool
Apktool 目前最新的版本是2.3.3，可以反编译查看AndroidManifest.xml和res文件下xml文件和图片，另外还可以打包apk，功能强大。
官网：https://ibotpeaches.github.io/Apktool/
下载及使用方法：
Linux:
- Download Linux wrapper script (Right click, Save Link As apktool)
- Download apktool-2 (find newest here)
- Rename downloaded jar to apktool.jar
- Move both files (apktool.jar & apktool) to /usr/local/bin (root needed)
- Make sure both files are executable (chmod +x)
- Try running apktool via cli
dex2jar
用来反编译源码，主要将dex文件反编译为jar，目前最新的版本是2.1，支持多dex的反编译。
官网：https://github.com/pxb1988/dex2jar
下载及使用方法:
linux版本需要注意脚本的执行权限的修改。
d2j-dex2jar.sh -f ~/path/to/apk_to_decompile.apk
And the output file will be apk_to_decompile-dex2jar.jar.
jd-gui
可以直接查看jar包，目前已经停止更新很久了，最新版本1.4。
官网：http://jd.benow.ca/
其他补充
简书有一遍文章更加详细，适合对反编译不是太清楚的看下：
https://www.jianshu.com/p/9a052b4f0656
