芯片分析中DEG如何解决"org.Mm.eg.db"加载失败的问题?

首先安装:

>BiocManager::install("org.Mm.eg.db")

>library(ggplot2)

>library(clusterProfiler)

>library(org.Mm.eg.db)

>s2e <- bitr(deg$symbol,

            fromType = "SYMBOL",

            toType = "ENTREZID",

            OrgDb = org.Mm.eg.db)#小鼠

#其他物种http://bioconductor.org/packages/release/BiocViews.html#___OrgDb

>deg <- inner_join(deg,s2e,by=c("symbol"="SYMBOL"))

>save(group_list,deg,logFC_t,P.Value_t,file = "step4output.Rdata")

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