介绍

anaconda相当于linux的一个软件仓库，也相当于一个环境管理器，可以使用conda创建不同环境，安装环境包，而不影响其他环境。

下载和安装

在官网下载anaconda3的安装脚本：

https://www.anaconda.com/products/individual

安装也非常简单，直接：

bash Anaconda3-2021.05-Linux-x86_64.sh

然后一路yes即可，我没有选择安装VSCode，因为感觉做生信分析没有必要安装

conda环境管理

conda create -n R4            # 创建名为R4的新环境

conda create -n py2 python=2.7            # 创建python2.7的新环境

conda env list            # 查看环境列表

source activate R4            # 进入R4环境

conda 设置清华源：

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda

# 设置搜索时显示通道地址

conda config --set show_channel_urls yes

conda clean -i

# 删除镜像源

conda config --remove channels https://XXXXXXXXXXXX 

# 查看镜像源

conda config --show-sources 

conda包管理

conda search r-base            # 查找包

conda install r-base=4.0.3            # 安装R语言版本4.0.3

conda删除环境

conda env remove --name 环境名